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ECOLOGÍA DEL SUELO Y SERVICIOS DE ECOSISTEMAS

El Suelo como hábitat

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Figura 1.1.1 Distribuciones de tamaños de poros en un oxisol que sustenta un bosque primario (línea continua) y un pastizal (línea de puntos) cerca de Manaos (Amazonia, Brasil) (según Grimaldi et al. 1993). Los valores de Fp correspondientes a la saturación de los tamaños de poro se indican en negrita y cursiva. Las flechas indican el límite de tamaño mínimo de los microorganismos y
microfauna. Tenga en cuenta que la compactación del suelo en los pastos reduce significativamente los hábitats de la microfauna a 5-10 cm de profundidad, mientras que el hábitat de los microorganismos aumenta a 2-5 cm.

1.1.1Introducción Los suelos proporcionan una inmensa variedad de hábitats que contienen una biodiversidad vasta y aún en gran medida desconocida, dispuesta en una combinación altamente organizada de una fase mineral sólida, una red de poros llenos de agua y aire y materia orgánica muerta en descomposición. Desde los primeros días del estudio de la ciencia del suelo, se ha hecho mucho para describir y comprender la transformación progresiva de los lechos de roca en suelos, incluida la distribución, la naturaleza y las características específicas de los componentes minerales y orgánicos, y las oportunidades y limitaciones que representan para la organismos (Lavelle y Spain 2001; Buol et al. 2003; Coleman et al. 2004; Bardgett et al. 2005). Sin embargo, analizar cómo funciona el suelo como hábitat es un énfasis más reciente, incluida la forma en que los organismos crean sus hábitats y viven en ellos. Los científicos del suelo han descrito la gradación vertical y a veces horizontal de los horizontes del suelo mediante una amplia variedad de sistemas de clasificación de suelos (Baize y Girard 1995; Soil Survey Staff 1999; Brady y Weil 2007). Los físicos del suelo han proporcionado descripciones detalladas de las fases sólida y porosa en sus intentos de modelar los procesos hídricos del suelo (Hillel 1980). Agrónomos y ecologistas han detallado cómo los suelos pueden proporcionar nutrientes y un sustrato físico para el crecimiento de las plantas. Existe una extensa literatura que detalla las transformaciones biológicas, físicas y químicas que ocurren durante la descomposición de la materia orgánica del suelo (mineralización y humificación) (Swift et al. 1979; Lavelle & Spain 2001). La adaptación a vivir en los suelos ha generado una amplia gama de formas de vida y rasgos biológicos específicos. Comprender estas adaptaciones requiere una visión holística de la naturaleza de los suelos, vinculando procesos físicos, químicos y biológicos y tratando de comprender qué implica realmente ser una bacteria o un colémbolo en este entorno. La comprensión de estas adaptaciones es un paso obligatorio antes de que se desarrollen modelos conceptuales del suelo como hábitat dentro de diferentes contextos ambientales, o antes de que se describa la teoría intuitiva (Pachepsky et al. 2001; Lavalle 2009). Por ejemplo, recientemente existe un considerable interés en la estequiometría y las consecuencias ecológicas de las diferencias entre el suministro de nutrientes del suelo y las necesidades de estos nutrientes de los organismos vivos (Gignoux et al. 2001; Guillaume et al. 2001; Sterner & Elser 2002, Osler & Sommerkorn 2007; Hättenschwiler et al. 2008; Marichal et al. 2011). El suelo es un refugio para un gran número de taxones muy antiguos (en términos evolutivos) y un entorno con una gran y enigmática biodiversidad (Anderson 1975). Este tema ha despertado mucho interés. Posteriormente, la biodiversidad en los suelos y su relación con la función del suelo también se ha convertido en un tema muy debatido (por ejemplo, Lavelle et al. 1995; Brussaard et al. 1997; de Ruiter et al. 1998; Andrén & Balandreau 1999; Wolters 2001; André et al. 2002; Muro 2004; Coleman y Whitman 2005; Crawford et al. 2005; Fitter y cols. 2005). Este capítulo describe primero las principales limitaciones que enfrentan los organismos cuando viven en el suelo. Se analiza la forma en que los organismos del suelo han superado estas limitaciones, a través de la autoorganización a través de escalas. Finalmente, se explican las consecuencias que tiene para los suelos y su gestión su carácter autoorganizado. 1.1.2Condiciones en los suelos Los suelos son ambientes compactos donde la vida se concentra en un espacio poroso que normalmente comprende entre el 30% y más del 60% del volumen del suelo en los horizontes superiores. Vivir y moverse en este espacio es la primera limitación importante para los organismos del suelo. El tamaño de los poros es muy variable al igual que su conectividad, lo que puede servir tanto como una oportunidad como como un obstáculo para tener un hogar extendido. El espacio disponible teóricamente accesible a un organismo determinado puede verse aún más reducido por la naturaleza anfibia del sistema, en parte lleno de agua y en parte de aire. Los organismos del suelo deberían adaptarse primero a esta doble restricción tan importante. La segunda limitación importante en el suelo es que se alimentan principalmente de alimentos de baja calidad. Los recursos más abundantes son la hojarasca y la hojarasca leñosa depositada en la superficie del suelo, el material de raíces y la materia orgánica del suelo, un conjunto muy diverso de materiales con diferentes tamaños de partículas y composición química. Aunque relativamente abundantes, estos elementos son en su mayoría de baja calidad nutritiva y potencialmente difíciles de digerir, ya que a menudo combinan desequilibrios estequiométricos y altas concentraciones de compuestos que son muy resistentes a la digestión. Las hojas y también las raíces pueden tener una baja calidad de recursos debido a los metabolitos secundarios que sirven, entre otros, como defensa contra la herbivoría (Harborne 1990; Hol et al. 2004). Estas limitaciones químicas a menudo se ven exacerbadas por la distribución discreta del recurso cuando se combina en la matriz del suelo. 1.1.2.1 Habitar y moverse en suelos La porosidad total del suelo disminuye gradualmente desde los estratos superiores (a menudo que contienen hojarasca) hechos de trozos de material orgánico en descomposición acumulados de diferentes tamaños, hasta el suelo mineral más profundo. Mientras que la porosidad estructural, es decir, la porosidad construida mediante procesos físicos o biológicos, tiende a disminuir bruscamente, la porosidad que separa naturalmente partículas de diferentes tamaños y formas se vuelve progresivamente dependiente de la textura del suelo (es decir, la distribución del tamaño de los granos). Los poros estructurales son generalmente de gran tamaño y varían en su mayoría desde micrómetros a decímetros para algunos canales de raíces o galerías de lombrices y termitas, mientras que los tamaños de los poros texturales varían desde fracciones de micrómetros en suelos arcillosos puros hasta un máximo de decenas de micrómetros en suelos arenosos. Sorprendentemente, aún no se ha logrado la distribución general de los poros entre las clases de tamaño y las mediciones completas de sus conectividades. Se utilizan diferentes metodologías para diferentes clases de tamaño y solo se consideran partes del espectro de porosidad, mientras que la conectividad basada en evaluaciones tridimensionales de tecnologías de imágenes de próxima generación, como la tomografía computarizada, aún está en desarrollo (p. ej. Grimaldi 1993; Vogel y Roth 2001; Pierret et al. 2002; Capowiez et al. 2003, 2011; Young y Crawford 2004; Braudeau et al. 2005; Chan y Govindaraju 2011). La porosidad del suelo no parece exhibir un patrón de distribución continuo en toda la gama de clases de tamaño; la distribución es bastante discontinua y aparentemente sigue un patrón fractal, con concentración de porosidades en escalas discretas (Fig. 1.1.1; Rieu y Sposito 1991; Grimaldi et al. 1993). Se pueden definir tres clases de poros según sus tamaños, el potencial mátrico asociado y la fuerza posterior que se aplicará para extraer las moléculas de agua sostenidas por fuerzas de tensión superficial: microporos, mesoporos y macroporos. Los microporos son poros texturales de un tamaño inferior a 0,15 um. Corresponden a los espacios acumulados entre las partículas del suelo y retienen agua a potenciales inferiores a -1,5 MPa (es decir, más allá del límite donde las plantas pueden extraer agua). Estos poros pueden comprender una gran proporción de la porosidad en suelos de textura fina, por ejemplo 1/3 de la porosidad total de un suelo arcilloso y ninguna en un suelo arenoso (Yong y Wark-entin 1975; Lavelle y España 2001). Los mesoporos son la fracción más pequeña de la porosidad estructural, oscilando entre 0,15 y ca. 30 micras. Retienen agua capilar, mantenida a tensiones de -1,5 MPa a -0,05 MPa, y están disponibles para las plantas. Estos poros comprenden vacíos texturales dejados por conjuntos de partículas de limo y arena y están construidos por una serie de pequeños organismos del suelo (como canales hechos por las raíces más finas o micelios de hongos (Cabidoche y Guillaume 1998) o intervalos entre construcciones microbianas como lo observaron Young y Crawford (2004) y por procesos físicos (grietas y espacios dejados entre los agregados físicos). Los macroporos comprenden la porosidad de gran tamaño del suelo de donde el agua drena casi libremente mientras la conexión de los poros lo permita. Son de origen bastante diverso y han sido creados por procesos físicos o biológicos. La formación de grietas por la retracción física de suelos que se secan o descongelan es un proceso bastante frecuente que crea macroporos físicos. La mayoría de los macroporos se deben a la bioturbación del suelo, que deja macroporos entre los agregados compactos creados por los excrementos de las lombrices o por los caminos compactados de las termitas, y a las actividades de excavación de los ingenieros del ecosistema del suelo (según lo define Jones et al. 1994), predominantemente raíces, lombrices y termitas. y hormigas (Capowiez et al. 2003, 2011; Nahmani et al. 2005; Cerda & Jurgensen 2008; Colloff et al. 2010; Jarvis et al. 2010). La conectividad de los poros de diferentes tamaños es un requisito previo muy importante para la vida en los suelos, ya que determina el dominio físico dentro del cual un organismo determinado puede moverse sin tener que excavar para salir. Aunque se sabe poco sobre la distribución discontinua de las redes de poros en los suelos, es probable que sea una limitación importante para el movimiento y la dispersión de los organismos. Al mismo tiempo, los aislamientos naturales de las poblaciones pueden protegerlas de sus posibles depredadores o competidores y favorecer la enorme biodiversidad observada entre los pequeños organismos del suelo (Postma & van Veen 1990; Young et al. 2008). 1.1.2.2 Respiración en suelos Después de un evento de lluvia o riego, los poros del suelo pueden llenarse completamente con agua. El drenaje vaciará primero los poros más grandes donde se retiene el agua a tensiones muy bajas, siempre que existan conexiones que permitan el drenaje. La evaporación y la evapotranspiración de las plantas eliminarán progresivamente el agua de los poros, primero los más grandes y luego los más pequeños (Papendick y Campbell 1981). Esto es el resultado de las fuerzas de retención de agua que están directamente relacionadas con la distancia entre la molécula de agua y la partícula sólida más cercana. El estado hídrico del suelo puede ser extremadamente variable y las condiciones ambientales pueden pasar de aeróbicas a acuáticas en unas pocas horas, mientras que la dinámica inversa suele ser más lenta. A capacidad de campo (pF 2,5 con una tensión de agua de -0,035 Mpa) todos los poros de un tamaño >10 um se llenan con agua. En pF4.2 (punto de marchitez permanente de las plantas), la tensión hídrica es de ca. -1,5 MPa y el tamaño de los poros todavía completamente llenos de agua es de 0,15 um. Los organismos que viven en agua con respiración acuática tienen mayores posibilidades de sobrevivir si son pequeños y, por lo tanto, viven en los poros más pequeños que permanecen llenos de agua durante períodos de tiempo más largos. En consecuencia, en un suelo a capacidad de campo (aprox. pF 2,5) en el que se ha transferido agua gravimétrica a partes inferiores del perfil o topografía del suelo, la película de agua tiene un espesor de 10 um, proporcionando así ambientes acuáticos a los microbios y a una serie de elementos de microfauna. . Los invertebrados más grandes encontrarán humedad continua y los meso y macroporos contendrán aire que permitirá la respiración. A pF 4,2, la película de agua es de sólo 0,15 um y una tensión de 2000 MPa supera la capacidad de las raíces para extraer agua. Esto explica por qué a pF 4,2 las plantas comienzan a marchitarse, los microorganismos tienen una actividad disminuida y los invertebrados sufren estrés hídrico. Sin embargo, el agua puede quedar retenida en poros de un tamaño mayor al esperado cuando tienen una abertura en forma de cuello de botella, ya que el diámetro de la abertura determina la tensión que se debe ejercer para extraer agua. La anfibiosis en los suelos impone limitaciones específicas a la fisiología de la respiración. La respiración puede ser de tipo acuático, basada en el uso de oxígeno disuelto con branquias o intercambios directos de membrana (por ejemplo, en bacterias y lombrices de tierra) o de tipo aéreo que implica la circulación de aire hacia los sistemas de tráquea o estructuras similares a los pulmones (por ejemplo, artrópodos o gasterópodos). ). Una serie de características fisiológicas y de comportamiento permiten a las especies hacer el mejor uso del ambiente del suelo a pesar de condiciones bastante inestables considerando las proporciones relativas de aire y agua en los poros. La conectividad de los poros de diferentes tamaños es un requisito previo muy importante para la vida en los suelos, ya que determina el dominio físico dentro del cual un organismo determinado puede moverse sin tener que excavar para salir. Aunque se sabe poco sobre la distribución discontinua de las redes de poros en los suelos, es probable que sea una limitación importante para el movimiento y la dispersión de los organismos. Al mismo tiempo, los aislamientos naturales de las poblaciones pueden protegerlas de sus posibles depredadores o competidores y favorecer la enorme biodiversidad observada entre los pequeños organismos del suelo (Postma & van Veen 1990; Young et al. 2008). 1.1.2.2 Respiración en suelos Después de un evento de lluvia o riego, los poros del suelo pueden llenarse completamente con agua. El drenaje vaciará primero los poros más grandes donde se retiene el agua a tensiones muy bajas, siempre que existan conexiones que permitan el drenaje. La evaporación y la evapotranspiración de las plantas eliminarán progresivamente el agua de los poros, primero los más grandes y luego los más pequeños (Papendick y Campbell 1981). Esto es el resultado de las fuerzas de retención de agua que están directamente relacionadas con la distancia entre la molécula de agua y la partícula sólida más cercana. El estado hídrico del suelo puede ser extremadamente variable y las condiciones ambientales pueden pasar de aeróbicas a acuáticas en unas pocas horas, mientras que la dinámica inversa suele ser más lenta. A capacidad de campo (pF 2,5 con una tensión de agua de -0,035 Mpa) todos los poros de un tamaño >10 um se llenan con agua. En pF4.2 (punto de marchitez permanente de las plantas), la tensión hídrica es de ca. -1,5 MPa y el tamaño de los poros todavía completamente llenos de agua es de 0,15 um. Los organismos que viven en agua con respiración acuática tienen mayores posibilidades de sobrevivir si son pequeños y, por lo tanto, viven en los poros más pequeños que permanecen llenos de agua durante períodos de tiempo más largos. En consecuencia, en un suelo a capacidad de campo (aprox. pF 2,5) en el que se ha transferido agua gravimétrica a partes inferiores del perfil o topografía del suelo, la película de agua tiene un espesor de 10 um, proporcionando así ambientes acuáticos a los microbios y a una serie de elementos de microfauna. . Los invertebrados más grandes encontrarán humedad continua y los meso y macroporos contendrán aire que permitirá la respiración. A pF 4,2, la película de agua es de sólo 0,15 um y una tensión de 2000 MPa supera la capacidad de las raíces para extraer agua. Esto explica por qué a pF 4,2 las plantas comienzan a marchitarse, los microorganismos tienen una actividad disminuida y los invertebrados sufren estrés hídrico. Sin embargo, el agua puede quedar retenida en poros de un tamaño mayor al esperado cuando tienen una abertura en forma de cuello de botella, ya que el diámetro de la abertura determina la tensión que se debe ejercer para extraer agua. La anfibiosis en los suelos impone limitaciones específicas a la fisiología de la respiración. La respiración puede ser de tipo acuático, basada en el uso de oxígeno disuelto con branquias o intercambios directos de membrana (por ejemplo, en bacterias y lombrices de tierra) o de tipo aéreo que implica la circulación de aire hacia los sistemas de tráquea o estructuras similares a los pulmones (por ejemplo, artrópodos o gasterópodos). ). Una serie de características fisiológicas y de comportamiento permiten a las especies hacer el mejor uso del ambiente del suelo a pesar de condiciones bastante inestables considerando las proporciones relativas de aire y agua en los poros. generalmente tiene bajas concentraciones de nutrientes. Los polifenoles y la lignina son a veces componentes abundantes de los materiales vegetales y generalmente son difíciles de digerir, si no tóxicos (Lavelle et al. 1993; Tian et al. 1995; Hättenschwiler y Vitousek 2000; Schweitzer et al. 2004). Además, tras la muerte de las hojas, los polifenoles se combinan con las proteínas creando compuestos proteicos polifenólicos altamente resistentes (Handley 1961; Toutain 1987; Palm & Sanchez 1991). Los polifenoles presentes en las vacuolas de las células vivas se mezclan con el contenido celular cuando las hojas mueren. Se combinan con proteínas citoplasmáticas y forman complejos hasta el 72% del nitrógeno de las hojas recién muertas y el 85% de las raíces (François et al. 1986). Sólo unos pocos organismos liberan eficientemente nitrógeno de estos compuestos, principalmente los hongos basidiomicetos conocidos como hongos de pudrición blanca. La actividad bacteriana en los intestinos de las lombrices también puede degradar estos sustratos (Toutain 1987). Esta descomposición se lleva a cabo bajo limitaciones físicas debido a la dureza ocasional de los tejidos y estructuras. La materia orgánica del suelo (MOS) es otro recurso abundante que comprende de 20 a >100 Mg ha' y se distribuye por todo el perfil del suelo en concentraciones que disminuyen con la profundidad. Análisis detallados revelan que este recurso, aunque abundante, presenta una serie de graves inconvenientes cuando se utiliza como recurso alimentario. Además de tener limitaciones estequiométricas similares a las de la hojarasca y la hojarasca leñosa, la MOS está enriquecida en compuestos húmicos polimerizados que pueden ser altamente resistentes a la descomposición y también formar complejos altamente estables con minerales arcillosos. La digestión de la MOS por parte de los invertebrados que se alimentan del suelo requiere actividades enzimáticas específicas además de la capacidad de ingerir grandes volúmenes de suelo enriquecido con OM mediante búsqueda selectiva de alimento como lo hacen las lombrices endogeicas polihúmicas (Lavelle 1983). Aunque varios modelos consideran una evolución continua más que discreta de la MOS (Gignoux et al. 2001), los ejercicios de observación y modelado tienden a apoyar una clasificación discontinua (Smith et al. 1997, 2002). Por ejemplo, el modelo CENTURY propone una clasificación discontinua de la materia orgánica en tres grupos diferentes (Parton et al. 1983; Jenkinson et al. 1987; Smith et al. 2002). El primero es un pool metabólico principalmente de biomasa microbiana, que tiene un tiempo de renovación relativamente rápido (2-4 años en condiciones de climas templados) y sólo comprende del 3-5% del C del suelo (Lavelle y España 2001). La biomasa microbiana, un recurso de alta calidad en teoría, solo representaría entre el 0,1% y el 0,3% del volumen total del suelo en la mayoría de los suelos, probablemente no suficiente para sustentar a un invertebrado geófago que utilizaría exclusivamente este recurso en ausencia de estrategias de alimentación altamente adaptadas. El segundo es un estanque físicamente protegido que comprende residuos orgánicos incluidos en agregados compactos del suelo y, por lo tanto, está aislado de sitios donde las actividades microbianas los descompondrían fácilmente. Este depósito, que generalmente incluye alrededor de la mitad del C no microbiano del suelo y tiene una renovación más prolongada (20 a 50 años en condiciones de clima templado), puede variar significativamente según el estado de la estructura física del suelo. En los vertisoles de la isla caribeña de Martinica, por ejemplo, la horticultura intensiva con una cobertura de suelo limitada puede disminuir el contenido de materia orgánica del suelo de 36 g C kg ' en pastos semipermanentes a 16 g C kg' después de 15 años de horticultura intensiva, tras la destrucción de agregados y la mineralización de la MO que había sido protegida físicamente (Blanchart et al. 2004). Después de 4 años de restauración de pastos, el contenido de C había aumentado hasta 24,8 g kg-' mientras que en un tratamiento sin plantas ni lombrices de tierra, el contenido de C disminuyó aún más hasta 14,1 g kg-1. La diferencia entre el valor de los pastos y el valor mínimo en horticultura corresponde a la MO físicamente protegida. La fracción físicamente protegida sólo es accesible a los organismos del suelo si se descomponen los agregados; además, se requiere una inversión energética bastante grande para utilizar materia orgánica que sólo comprende una proporción limitada (aprox. 5% en casos favorables) de los agregados. El tercero es un depósito químicamente protegido, generalmente equivalente a la cantidad del depósito físicamente protegido que comprende compuestos húmicos recalcitrantes con un tiempo de renovación muy largo (800-1200 años). Este MO permanece cuando los suelos han sido altamente degradados por, por ejemplo, prácticas agrícolas intensivas con labranza intensiva, retorno limitado de residuos orgánicos y suelo mantenido desnudo durante varios meses al año. En el ejemplo del vertisol de Martinica, esta reserva comprendería esencialmente el C restante después de 15 años de horticultura más 4 años sin cubierta vegetal, el 39% de la MOS total en este caso. Este conjunto puede descomponerse si la MO fresca permite un efecto de cebado sobre la actividad microbiana. La escasez de estos compuestos, especialmente en horizontes de suelos profundos, explicaría, al menos en parte, el largo tiempo de residencia de esta MO (Fontaine et al. 2007). Moco en las tripas de las lombrices de tierra (Martin et al. 1987) y los exudados en las rizosferas de las plantas (Brown et al. 2000; Kuzyakov 2002) son, sin embargo, conocidos por desencadenar tales efectos de preparación. Los recursos solubles, o recursos fácilmente asimilables, existen en los suelos en cantidades considerables. Procedentes directamente del metabolismo del organismo, comprenden exudados de raíces o micorrizas, moco de lombriz y algunas otras fuentes menores. Los exudados de raíces y otros elementos sólidos de la rizodeposición son una fuente bastante abundante que comprende en promedio el 17% del C neto fijado mediante la fotosíntesis (Nguyen 2003). Se liberan en los suelos principalmente como polisacáridos con pesos moleculares relativamente bajos. Esto representa una cantidad total de varios Mg de masa seca ha', una masa bastante considerable de C fácilmente asimilable. Aunque los contenidos de N informados en los exudados son generalmente bajos, Wichern et al. (2008) indican que entre el 4% y el 71% del N vegetal total asimilado se puede encontrar en los depósitos de las raíces, con medianas respectivas del 16% en leguminosas y 14% en cereales. Aunque muchos estudios se han centrado en los elementos presentes en concentraciones muy bajas en los exudados (hormonas y micronutrientes), en realidad representan una fuente de C muy grande y fácilmente disponible que tiene profundos efectos sobre las actividades microbianas y faunísticas en la rizosfera (Gregory 2006). El uso de la rizodeposición como recurso para los organismos del suelo provoca una serie de limitaciones para los organismos de la rizosfera. Los recursos basados en rizodeposición generalmente tienen bajos contenidos en nutrientes, lo que obliga a los organismos que viven en ellos a buscar fuentes complementarias fuera de la rizosfera y/o adaptar su metabolismo de C a esta condición (Kuzyakov et al. 2000; Muhammad et al. 2007). También son un recurso pulsado que se produce en momentos específicos y en las puntas de las raíces con un patrón de distribución muy discreto en el volumen del suelo. Su distribución desigual en el volumen del suelo y su patrón temporal impredecible de producción requieren estrategias altamente específicas para su uso por parte de organismos heterótrofos. Los hongos micorrízicos que se benefician directamente de la asignación de C de las plantas a las raíces al tomar C del interior de las raíces probablemente utilizan una gran parte de los recursos translocados de las plantas al suelo (Högberg y Read 2006). El moco intestinal y cutáneo de las lombrices de tierra tienen una función similar a los exudados de las raíces, aunque con diferentes composiciones. Los mocos son glicoproteínas de pesos moleculares relativamente bajos producidas en la superficie del cuerpo de las lombrices como lubricante o agregadas al contenido intestinal en el proceso de digestión (Cortez y Bouché 1987; Martin et al. 1987). Aunque rara vez se ha estimado la composición y cantidad de moco cutáneo perdido en el suelo, Jegou et al. 2001), sus efectos sobre las actividades microbianas en el revestimiento de las madrigueras de lombrices son bien conocidos. El moco intestinal es quizás un componente más importante en los ecosistemas donde abundan las lombrices de tierra que el moco cutáneo. El moco intestinal es una glicoproteína de 40 a 60 mil Da de tamaño que se agrega en proporciones del 5 al 37% en peso seco equivalente al alimento ingerido en la parte anterior del intestino (Martin et al. 1987; Trigo et al. 1999). . Aunque se reabsorbe en gran medida en el intestino posterior, este moco representa un rico recurso que es utilizado por la microflora ingerida durante el tiempo de tránsito de 20 min a 4 h del suelo a través de esta parte de los intestinos de las lombrices (Lavelle et al. 1995). 1.1.3Estrategias adaptativas de los organismos del suelo. Según sus respectivos tamaños, formas de vida y fisiología, los organismos del suelo han desarrollado diferentes tipos de estrategias adaptativas para hacer frente a las tres limitaciones principales del hábitat del suelo de forma individual o mediante asociaciones mutualistas. De hecho, algunos están mejor adaptados que otros para afrontar las limitaciones del entorno del suelo. Esta situación ha llevado al desarrollo de asociaciones en las que se comparten fortalezas adaptativas complementarias. Una consecuencia interesante es que la autoorganización basada principalmente en intensas interacciones mutualistas y/o no tróficas entre organismos parece ser un proceso predominante en los suelos que a su vez ha promovido un modo de funcionamiento que es único en la biosfera. Ninguno de los grupos de organismos del suelo está adaptado de manera óptima a cada una de las tres limitaciones principales del suelo. El tamaño refleja en gran medida la capacidad para enfrentar cada tipo de restricción (Lavelle et al. 1997; Fig. 1.1.2; Tabla 1.1.1). Una característica notable del desarrollo de los suelos ha sido la coevolución entre organismos con estrategias adaptativas muy diferentes que les ha permitido adaptarse a un entorno severamente restrictivo. Dado que ninguno de los organismos individualmente pudo adaptarse completamente a las tres limitaciones principales, las interacciones han aprovechado al máximo las principales capacidades de cada uno. 1.1.3.1 Digestión y cooperación Todos los demás organismos aprovechan la extraordinaria capacidad de la comunidad microbiana para digerir los sustratos más recalcitrantes (como la celulosa, la quitina, la lignina o los compuestos proteicos fenólicos) y producir una amplia gama de productos similares a las hormonas. Estos, a su vez, proporcionan mecanismos más o menos sofisticados para la selección y estimulación de las actividades de las poblaciones microbianas (incluida la depredación) y su transporte a nuevos sustratos para su descomposición. En general, los invertebrados tienen capacidades relativamente limitadas para digerir compuestos orgánicos. Algunas lombrices de tierra, por ejemplo, no tienen enzimas celulolíticas adecuadas (Lattaud et al. 1999). Las celulasas que se encuentran en el intestino son liberadas al menos en parte por la microflora del suelo ingerida en la parte media del intestino. Estos microorganismos se estimulan primero de forma selectiva en la parte anterior del intestino, donde se añade un volumen de agua y entre el 5 y el 35 % del peso de la tierra ingerida como moco intestinal y se produce una mezcla energética (Barois y Lavelle 1986; Trigo et al. 1999). . Una vez que se restablece su plena actividad, comienzan a digerir sustratos orgánicos y a liberar sustratos en el intestino que pueden ser asimilados por ellos mismos y por los gusanos. Otros ejemplos de digestión y cooperación son la transferencia de enzimas de bacterias a nematodos o mutualistas simbióticos. Un ejemplo de transferencia horizontal entre bacterias y nematodos fitoparásitos sugiere que la cooperación entre invertebrados y microorganismos en la digestión de recursos de baja calidad puede ser mucho más amplia y diversa de lo que se imagina actualmente (Smant et al. 1998). Los hongos musco-orrízicos desempeñan funciones especiales en los suelos al proporcionar a las plantas nutrientes que se alimentan fuera de la zona de las raíces, en asociación con microorganismos libres que viven en su micorrizosfera (Hög-berg & Read, 2006). Se proporciona más información sobre este tipo de interacciones en el Capítulo 1.2 de Wurst et al. (este volumen). 1.1.3.2 Movimientos, construcción de hábitat y bioturbación La capacidad de los ingenieros de ecosistemas del suelo para cavar, excavar y mezclar constantemente el suelo es esencial para la expansión y el mantenimiento del espacio poroso estructural y para la selección y redistribución de microorganismos. Las raíces realizan una considerable "perforación biológica" (Cresswell y Kirkegaard 1995; Angers & Caron 1998), un proceso bien reconocido pero aún pobremente cuantificado. Las lombrices de tierra son los bioturbadores más eficientes del suelo, capaces de ingerir y egerir como macroagregados sólidos hasta 1200 Mg de suelo seco por ha (Lavelle y España 2001) y perforar hasta 900 m de galerías por m (Kretzschmar 1982). Producen macroagregados con propiedades bastante complejas en cuanto a distribución y secuestro de materia orgánica (Martin 1991; Fonte et al. 2007). Las termitas y las hormigas son otros poderosos ingenieros de ecosistemas que completan o reemplazan las actividades de las lombrices en la mayoría de los ecosistemas donde están presentes (Lobry de Bruyn y Conacher 1990). En condiciones específicas, se ha afirmado que los isópodos son responsables de importantes transferencias de suelo (Yair 1995; Jones et al. 2006; Davidson et al. 2010). Además de las principales actividades de estos importantes ingenieros, la mayoría de los organismos del suelo desarrollan cierto grado de actividades de ingeniería, aunque a escalas más pequeñas. La ingeniería física microbiana, por ejemplo, puede ser importante cuando se miden con precisión los cambios a muy pequeña escala en la distribución de partículas y la perforación de canales microscópicos por parte de micelios fúngicos (Cabidoche y Guillaume 1998; Young y Crawford 2004). 1.1.3.3 Condiciones anfibióticas Dependiendo de la dependencia del agua libre en el suelo, los organismos han desarrollado diferentes grados de resistencia, desde quistes y esporas hasta estados de reposo o estados inespecíficos que involucran diferentes grados de desecación y/o construcción de estructuras específicas (Jiménez et al. 2000; Figura 1.1.3). La resistencia a la desecación generalmente aumenta a medida que disminuye el tamaño (Lavelle y España 2001), aunque algunos invertebrados relativamente grandes, como las hormigas, pueden sobrevivir en ambientes extremadamente secos. 1.1.4 Autoorganización y organización espacial de los suelos La autoorganización ha llevado a los organismos del suelo a desarrollar interacciones y adaptarse a las limitaciones del suelo (Lavelle et al. 2004a; Lavelle et al. 2006). Los ingenieros de ecosistemas del suelo utilizan la energía movilizada a través de las actividades microbianas y la fotosíntesis (para las plantas y sus raíces) para construir hábitats en la matriz compacta del suelo y vivir allí en mutualidad con los organismos asociados con ellos. La cuestión teórica de si al hacerlo realmente extienden su fenotipo y aumentan su aptitud o simplemente tienen un efecto accidental en otros organismos todavía se debate (Couquet et al.) 2006). 1.1.4.1 Los suelos como sistemas autoorganizados Los suelos pueden considerarse sistemas autoorganizados de acuerdo con los criterios definidos a continuación (Perry 1995; Lavelle et al. 2006): 1. Se caracterizan por un orden donde se habría predicho el desorden. La organización de los horizontes del suelo, la distribución de los poros entre clases de tamaño y su disposición espacial, la estructura de las comunidades microbianas y de invertebrados y las redes alimentarias se encuentran entre los muchos ejemplos de "organización" y "orden" en los suelos. 2. Las estructuras y los procesos se refuerzan mutuamente. Un ejemplo obvio es la construcción de nidos epigeos por insectos sociales que los protegen de condiciones climáticas peligrosas y de depredadores. Otro ejemplo es el mantenimiento de la porosidad estructural del suelo por parte de invertebrados y raíces que, a su vez, mejora sus propias actividades y otras actividades biológicas asociadas al mejorar la capacidad de infiltración y almacenamiento de agua. 3. El sistema mantiene el orden dentro de los límites mediante interacciones internas. De hecho, las observaciones específicas tienden a mostrar que los dominios funcionales de los ingenieros de ecosistemas del suelo, es decir, el volumen de suelo que está moldeado por sus actividades (Lavelle 2002), tienen límites reconocibles. Estos se pueden extraer, por ejemplo, observando las firmas espectrales del infrarrojo cercano (NIRS) de los macroagregados que comprenden su dominio (Hedde et al. 2005). A gran escala, las poblaciones de lombrices, termitas o raíces a menudo se distribuyen en parches dentro de los cuales los suelos tienen características y funciones notablemente específicas (Elridge y Greene 1994; Rossi et al. 1996; Jouquet et al. 2006). En las escalas más pequeñas, la observación precisa de los ambientes microbianos también revela cierto grado de construcción del hábitat (Cabidoche y Guillaume 1998; Young y Crawford 2004). A pesar de la dificultad para clasificar rigurosamente el tipo de interacciones desarrolladas en estos sistemas, parece estar basado en gran medida en mutualismo y/o relaciones no tróficas similares a la ingeniería de ecosistemas Jones et al. 1994). 4. Lejos del equilibrio, estos sistemas se encuentran efectivamente en un estado de equilibrio dinámico. Los experimentos muestran que la función física del suelo puede modificarse profundamente cuando las perturbaciones afectan la actividad de los invertebrados (Blanchart et al. 1997; Mando 1997; Barros et al. 2001). Las especies invasoras, por ejemplo, pueden mejorar desproporcionadamente una función (por ejemplo, producir grandes estructuras compactas o mineralizar la materia orgánica acumulada en las capas de humus) de manera que el sistema ya no mantenga su equilibrio dinámico (Chauvel et al. 1999; Hendrix 2006). Cuando son eliminados por prácticas agresivas de manejo de la tierra, las condiciones ambientales que mantenían en su esfera de influencia pueden cambiar drásticamente; un ejemplo puede ser la desaparición del control ejercido por las comunidades de nematodos fitoparásitos sobre las especies más agresivas de su propia comunidad cuando se aplican nematicidas y, en última instancia, dejan a las especies más agresivas sin competidores (Lavelle et al. 2004b). 5. Se puede considerar que los sistemas naturales comprenden una jerarquía de sistemas autoorganizados integrados, estabilizados por relaciones cooperativas y centrados en fronteras espaciales y temporales. Por lo tanto, la función del suelo se concibe como una combinación de procesos que vincula procesos de rápido desarrollo a pequeña escala con procesos progresivamente de mayor escala y más lentos (Fig. 1.1.4). La analogía con los dispositivos mecánicos está respaldada por la observación de escalas discretas para las interacciones en los suelos y diferentes velocidades en los procesos. Esta visión es claramente opuesta a la supuesta por los modelos que presentan el funcionamiento del suelo como redes complejas de interacciones sin una organización espacial específica ni restricciones espaciales específicas. 1.1.5 Escalas discretas en la función del suelo Se han identificado cinco escalas relevantes en la función del suelo (Fig. 1.1.4). En cada escala, las interacciones entre organismos de uno o varios grupos se desarrollan dentro de los límites de estructuras tales como biopelículas, mesoagregados o dominios funcionales de ingenieros de ecosistemas de invertebrados (Lavelle et al. 2004a). Aunque estas escalas se reconocen implícitamente, basándose en observaciones, la evidencia de una organización tan discreta del medio ambiente del suelo es todavía bastante débil. Si bien se observan patrones discretos tanto en la porosidad como en la distribución del fraccionamiento de agregados (Menéndez et al. 2005; Globus 2006; Fedotov et al. 2007), los datos aún son bastante escasos y fragmentarios. Estudios que consideren la aplicación del modelo fractal a, p.e. porosidad del suelo, se han aplicado con éxito a parte del rango de porosidad del suelo, pero, sorprendentemente, ningún estudio ha considerado nunca todo el rango de porosidades. Escala 1: biopelículas microbianas. El hábitat más pequeño en los suelos está representado por conjuntos de partículas minerales y orgánicas de aproximadamente 20 um de tamaño, llamados microagregados (Fig. 1.1.4, Escala 1). La mayoría de las transformaciones químicas que resultan en el ciclo de la materia orgánica y la fertilidad química del suelo son realizadas por microorganismos en micrositios y biopelículas. Con algunas excepciones (por ejemplo, costras superficiales formadas por cianobacterias; Leys y Elridge 1998), estas estructuras están incrustadas en estructuras de mayor escala fabricadas y/o habitadas por organismos más grandes que organizan el espacio a escalas mayores. Escala 2: microredes alimentarias. Los microorganismos pueden vivir dentro (por ejemplo, en microporos llenos de agua) o fuera de los mesoagregados del suelo (aprox. 100-500 um; Hat-tori y Hattori 1976), lo que a su vez determina su acceso a los recursos, su exposición a los depredadores y su inclusión como presa en Sistemas de microredes alimentarias (Escala 2). A esta escala, los microagregados forman conjuntos que dejan espacios entre ellos donde solían vivir microdepredadores, como nematodos y protistas que viven de biomasa microbiana y controlan sus poblaciones y actividades. A esta escala también pertenecen conjuntos específicos de microorganismos de la rizosfera. Las micorrizas y su micorrizosfera operan a la misma escala, lo que representa una opción autótrofa para interacciones en esta escala particular (Högberg & Read 2006). Escala 3: dominios funcionales de los ingenieros de ecosistemas (Lavelle 2002). En la escala de decímetros a decámetros, los ingenieros de ecosistemas y los factores abióticos determinan la arquitectura de los suelos a través de la acumulación de agregados y poros de diferentes tamaños, microagregados de Escala 1, mesoagregados de Escala 2 y macroagregados que estos producen. Estas esferas de influencia (= dominios funcionales) (Escala 3) se extienden horizontalmente sobre áreas que van desde decímetros (por ejemplo, la rizosfera de una mata de hierba) hasta 20-30 m (drilosfera de una determinada población de lombrices) o más, y desde unos pocos centímetros hasta unos pocos metros de profundidad. , dependiendo del organismo (Decaëns & Rossi 2001; Jimenez et al. 2001). Escala 4: mosaicos de dominios funcionales a escala de parcela. Los dominios funcionales se distribuyen en parches que pueden tener distribuciones discretas o anidadas y forman juntos un mosaico de parches (Escala 4). Un mosaico de este tipo ha sido descrito, por ejemplo, por Rossi. (2003) quienes observaron la distribución de dos grupos de lombrices con efectos opuestos en los suelos. Un grupo llamado "compactación" estimularía la macroagregación del suelo a través de la acumulación de heces compactas grandes (aproximadamente 1 cm) y reduciría la macroporosidad del suelo con los consiguientes valores altos de la densidad aparente del suelo (Blanchart et al. 1997). Otro grupo denominado "descompactación" tendría un efecto opuesto al romper agregados grandes en pedazos más pequeños con una disminución resultante en la densidad aparente y una mayor densidad de raicillas que encuentran un ambiente más adecuado en estos parches. Probablemente existan diseños más complejos que mezclan dominios espaciales de termitas, hormigas, lombrices y raíces de plantas, aunque rara vez se han abordado su estructura y las relaciones entre sus diferentes constituyentes. Sin embargo, todavía se sabe poco sobre la organización espacial de los dominios funcionales de todas las comunidades de ingenieros de ecosistemas. Por ejemplo, es necesario investigar si las rizosferas de las raíces y los dominios funcionales de los ingenieros de ecosistemas de invertebrados son entidades separadas. Las señales espectrométricas del infrarrojo cercano de los macroagregados del suelo muestran señales claramente diferentes para los biogénicos. estructuras formadas por diferentes especies de macroinvertebrados. También muestran que dentro de la matriz del suelo, algunos macroagregados pueden haber sido construidos en común por raíces y lombrices de tierra, mientras que otros exhiben señales específicas únicas (Zhang et al. 2009; Hedde et al. 2005; Zangerlé et al. 2011). Escala 5: paisaje/cuenca. A nivel de paisaje conviven diferentes ecosistemas en un mosaico con patrones claramente definidos (Escala 5). La aparición y distribución de tipos de cobertura terrestre en los paisajes pueden ser el resultado de variaciones naturales en el medio ambiente y/o la gestión humana de la tierra. Los procesos de formación de suelos, por ejemplo, son muy sensibles a la topografía, lo que genera la formación de catenas de suelos desde las zonas superiores hacia las inferiores. Diferencias significativas en el tipo de suelo a esta escala a menudo determinan diferentes tipos de vegetación y la formación de un mosaico de ecosistemas (Sabatier et al. 1997). En las regiones de sabana de África occidental, las mesetas que tienen un suelo espeso y un horizonte de grava a menudo están cubiertas de bosques abiertos. Las laderas que tienen suelos menos profundos tienen menos árboles; Las zonas bajas presentan suelos de textura fina resultantes del transporte y acumulación de elementos finos desde las zonas superiores. También son ambientes más húmedos donde la vegetación se compone de pastos y hierbas. En las zonas ribereñas de las cuencas fluviales, los bosques de galería pueden utilizar la disponibilidad constante de agua de un nivel freático ubicado cerca de la superficie (Brabant 1991). Por otro lado, cada vez hay más pruebas de que la composición y estructura de los mosaicos artificiales creados con la gestión del suelo tienen efectos sobre la biodiversidad y la distribución de los hábitats del suelo (Lavelle et al. 2010). La formación de suelos a escalas regionales es uno de los servicios ecosistémicos que integra procesos a todas las escalas; es un proceso lento que se extiende durante largos períodos de tiempo y está determinado en gran medida por las condiciones climáticas y la naturaleza del material original. En zonas templadas, por ejemplo, se necesitan 20.000 años para transformar el material original de aluminosilicato en un suelo de capa espesa, pero se necesita la mitad de ese tiempo para desarrollar material rico en carbonatos (Chesworth, 1992). La mayoría de los suelos en el norte de Europa y América que se formaron después del retroceso de los glaciares hace 20.000 años todavía tienen propiedades de suelos relativamente jóvenes, en comparación con los suelos de Australia o algunas partes de África que comenzaron a formarse hace millones de años (Fyfe et al. 1983). 1.1.6 El desafío de un uso ecoeficiente de los suelos La estrecha interdependencia en todos los niveles de integración de los organismos, las comunidades, sus hábitats en los suelos y los procesos ecosistémicos desarrollados en estos entornos tiene fuertes desafíos científicos e implicaciones prácticas. Los científicos deben desarrollar teorías y herramientas para caracterizar, clasificar y evaluar los suelos considerando todos estos niveles de integración involucrados. Luego, estas herramientas pueden ser utilizadas por científicos y profesionales para definir las condiciones para un uso ecoeficiente de los suelos con el objetivo de una combinación de desarrollo económico y social al tiempo que se conserva o mejora el capital natural. En última instancia, la práctica puede crear agroecosistemas con todas las unidades funcionales necesarias reunidas para optimizar la producción de bienes y servicios ecosistémicos. 1.1.6.1 Desarrollando la teoría El modelo de autoorganización de los sistemas edáficos sigue siendo una visión intuitiva, aunque alimentada por una gran cantidad de observaciones precisas y hechos probados. Un elemento clave que debe probarse es la realidad de la distribución discreta de unidades funcionales en todas las escalas probando la organización discontinua del espacio poroso en todas las escalas espaciales. Aunque se ha proporcionado evidencia para algunas escalas a partir de la observación (Grimaldi et al. 1993) o ejercicios de modelado (Menéndez et al. 2005), las evaluaciones de todas las porosidades, desde los poros texturales más pequeños hasta los macroporos más grandes, realizadas por ingenieros de ecosistemas y procesos físicos. son requeridos. Covariaciones significativas entre las mediciones de biodiversidad y la diversidad de los tamaños de poros indicarían que la composición y estructura del hábitat son importantes para determinar la biodiversidad en los suelos. De hecho, los desarrollos teóricos sobre la biodiversidad en los suelos tienden a pasar por alto en gran medida las limitaciones físicas de los procesos biológicos. La teoría debería entonces describir cómo la evolución impulsada por las limitaciones del suelo ha llevado a las comunidades a formar sistemas autoorganizados con mecanismos de interacción específicos, aunque en gran medida ignorados. La producción de exudados por las raíces es un ejemplo simple de un mecanismo trófico que organiza comunidades de descomponedores y redes alimentarias en la rizosfera (Lambers et al. 2009). La composición y los flujos de exudados son rasgos de las plantas que ciertamente influyen en las actividades microbianas en los suelos y sus interacciones con otros organismos. A medida que se acumulan investigaciones sobre el tema, han aparecido interacciones más complejas, que implican transferencias horizontales de genes o efectos sobre la expresión genética (Smant et al. 1998; Ashelford et al. 2001). La creación de estructuras físicas en el suelo que actúan como extensiones de fenotipos es otro mecanismo que puede haber aumentado la aptitud a nivel de especies y comunidades (Jouquet et al. 2006) al influir en los procesos a sus escalas. Por lo tanto, los científicos deberían investigar las comunidades, el hábitat, la posible creación de estructuras físicas y la participación en los procesos operados para cada unidad funcional ilustrada como elementos del modelo conceptual de la Fig. 1.1.4. Esto permitiría probar la existencia de patrones generales en la constitución de unidades funcionales en cada escala y evaluar los sistemas autoorganizados, su biodiversidad y participación en la formación de estructuras físicas del suelo y en la provisión de servicios ecosistémicos a sus escalas. Finalmente, una cuestión importante es la adaptación de las unidades funcionales observadas en una escala a las adyacentes. Cuando las plantas, los microorganismos y la fauna han coevolucionado durante períodos de tiempo muy largos, la introducción de elementos extraños, como plantas de cultivo y microorganismos introducidos en sistemas gestionados, y la desaparición de la fauna local pueden cambiar y/o perjudicar las funciones basadas en interacciones entre estos organismos (por ejemplo, adaptación de micorrizas locales a plantas introducidas o respuesta de un cultivar introducido a cambios locales en la expresión genética inducidos por lombrices de tierra). La falta de coincidencia entre los elementos introducidos artificialmente puede perjudicar algunas funciones del ecosistema. La compactación del suelo por lombrices de tierra invasoras en pastos tropicales (Chauvel et al. 1999), o la baja capacidad de algunos cultivares recientes de soja para seleccionar las hebras de rizobio más eficientes (Kiers et al. 2007), son ejemplos de tales desajustes. 1.1.6.2 Composición de comunidades autoorganizadas a una escala determinada Se espera que largos períodos de coevolución hayan seleccionado la mejor combinación de organismos, basándose en el principio general propuesto por Allee et al. (1949) que las interacciones entre organismos cambian progresivamente de adversas a neutrales y mutualistas. El grado más alto de interacción está representado por la simbiogénesis, es decir, la fusión de varios organismos en uno solo que se beneficia de las capacidades de cada componente (Mereschkowsky 1926; Margulis & Sagan 2002). Siguiendo esta lógica, las plantas deben haber coevolucionado, p.e. con hongos micorrízicos que se han adaptado mejor a una población de plantas determinada en un entorno determinado. Bezemer et al. (2010) muestran que las comunidades de nematodos en rizoesferas de ocho especies de plantas diferentes son específicas de cada planta (autoorganización en la Escala 3) y también dependen hasta cierto punto de la composición de la comunidad de plantas donde crecen estas especies de plantas (Escala 4). Estos ejemplos muestran el interés de probar la existencia de interacciones específicas entre componentes de comunidades dentro de cada escala e identificar los rasgos de los organismos que hacen que las especies (de plantas, invertebrados o microorganismos) sean más o menos compatibles y mutuamente beneficiosas. Los rasgos fisiológicos y genéticos probablemente estén profundamente involucrados en la calidad de las interacciones interespecíficas. Por ejemplo, los efectos positivos de las lombrices de tierra sobre el crecimiento de las plantas pueden estar mediados por colonias bacterianas específicas que liberan promotores del crecimiento de las plantas en los excrementos de las lombrices, con efectos generales o específicos de cada especie sobre las plantas (Tomati et al. 1988; Blouin et al. 2005). Por otro lado, se han observado diferencias en la respuesta de cinco cultivares de arroz a la inoculación de la lombriz Pontoscolex corethru-rus y a la aplicación de biocarbón (Noguera et al. 2011). Este resultado lleva a la pregunta de si la adaptación de los cultivares de plantas a las condiciones del suelo bajo prácticas intensivas convencionales no ha llevado a la pérdida de genes específicos involucrados en las interacciones entre las plantas y las lombrices de tierra. En condiciones similares de selección intensiva de plantas, Kiers et al. (2007) muestran que las leguminosas tienden a perder su defensa contra rizobios ineficaces. La calidad de las interacciones dentro de cada escala debe evaluarse con indicadores específicos. Se basarían en atributos tales como la diversidad de los diferentes componentes (comunidades microbianas y faunísticas en unidades funcionales en las escalas 1 a 3) y su compatibilidad evaluada mediante pruebas estándar de laboratorio o de campo (por ejemplo, respuesta de las plantas a las comunidades microbianas o faunísticas presentes en el suelo, la longitud y la complejidad de las redes alimentarias en la Escala 2). 1.1.6.3 Estructuras físicas como hábitat de organismos Un segundo atributo importante de las unidades funcionales representadas en la Fig. 1.1.4 es la creación de un conjunto de estructuras que forman hábitats para los organismos (Ritz & Young 2011). Estas estructuras pueden describirse con parámetros físicos y químicos como tamaño, forma, textura, contenido de nutrientes y orgánicos, y resistencia a diferentes tipos de agresiones físicas, actividades enzimáticas o señales espectrométricas del infrarrojo cercano (Decaëns et al. 2001; Hedde et al. . 2005). Su localización y disposición espacial, la importancia, distribución de tamaños y conectividad del espacio poroso que producen también son atributos importantes a analizar, al menos en las diferentes escalas del 1 al 4. La mera existencia de estructuras, incrustadas en escalas espaciales anidadas que forman el fundamento de la visión conceptual, debe verificarse y compararse patrones para buscar leyes generales e indicadores de su organización en diferentes ecosistemas. Los indicadores compuestos deberían caracterizar los hábitats creados en las diferentes escalas. La distribución y diversidad de tamaños y formas de poros y el volumen promedio de poros interconectados de un tamaño mínimo dado evaluarían la capacidad de los suelos para albergar organismos de diferentes tamaños y el volumen real de poros interconectados a los que pueden acceder físicamente. Grandes volúmenes de poros interconectados permitirían que poblaciones más grandes vivieran con mayores posibilidades de intercambiar material genético. La estabilidad en el tiempo de estas estructuras, que determina el número de generaciones que vivirían en este espacio, probablemente depende de su resistencia física y del ritmo al que los ingenieros de ecosistemas producen nuevas estructuras. La resiliencia de las estructuras del suelo y los patrones de biodiversidad en las diferentes escalas probablemente estarían relacionados con estos aspectos de la composición y dinámica de sus hábitats. 1.1.6.4 Procesos en unidades funcionales a diferentes escalas Una consecuencia interesante de la autoorganización en los suelos es la creación de unidades discretas donde las funciones pueden operar con dinámicas diferentes e incluso opuestas debido a la diversidad de hábitats que representan y de los recursos que ofrecen. Esta característica permite, por ejemplo, mantener micrositios anaeróbicos en un suelo con una situación aeróbica global. ción (Sextone et al. 1985), y obtener mineralización de P y N en micrositios de suelos con altas proporciones promedio C:nutrientes. Los excrementos de lombrices, las estructuras unitarias del dominio funcional de la drilosfera, presentan tales condiciones para la composición y organización específicas de las partículas que abarcan. Un resultado práctico del modelo autoorganizado es que la evaluación de las comunidades microbianas y las actividades realizadas en suelo tamizado a granel puede no proporcionar una evaluación realista de las actividades. En este enfoque, todos los microbios reciben condiciones óptimas y homogéneas para su actividad donde se organizaban en el espacio y el tiempo micrositios activos e inactivos y también sitios con patrones posiblemente opuestos. Por ejemplo, la composición y las actividades microbianas en la rizosfera varían según la especie de planta y en el tiempo, desde el momento en que la punta de la raíz llega al micrositio, hasta diferentes fases de un proceso sucesional (Garrett et al. 2001; Bonkowski 2004; Innes et al. al. 2004; Lambers et al. 2009). 1.1.6.5 Conexión de unidades funcionales dentro y entre escalas La imagen de unidades conectadas (numeradas del 1 al 5 en la Fig. 1.1.4) que representan las unidades funcionales del suelo y su dinámica a diferentes escalas, sugiere que la conexión entre unidades funcionales puede depender de su forma y de la presencia de lubricante para facilitar la transmisión. del movimiento. Probablemente existan efectos similares en los suelos, ilustrados, por ejemplo, por el concepto de sincronía en los procesos de descomposición (Swift et al. 1979) que postula que, en sistemas eficientes en nutrientes, la liberación de nutrientes provenientes de la descomposición en sistemas naturales se ajusta a las necesidades de las plantas. al mismo tiempo, evitando así pérdidas de nutrientes (Fig. 1.1.5). En este caso, los nutrientes se liberan en sitios microbianos (Escala 1), posiblemente regulados por procesos de la red alimentaria (Escala 2) dentro del dominio funcional de un árbol (sistema de hojarasca, Escala 3) o de un ingeniero de ecosistemas de invertebrados (drilosfera de una población de lombrices de tierra) y transferido a otro dominio funcional, la rizosfera de una planta. La sincronía en el tiempo y la sinlocalización en el espacio (van Noordwijk et al. 1993) pueden promoverse mediante respuestas sincrónicas a los principales impulsores climáticos y la organización espacial que determina la localización de los organismos y la circulación de nutrientes en los flujos de agua. Otras interfaces similares deben ser numerosas y muchas de ellas aún son en gran medida desconocidas o ignoradas. 1.1.7 Enfoques para la investigación ecológica del suelo La vida en el suelo sólo ocurre en el espacio poroso. Los organismos que pueden excavar crean su espacio adecuado, mientras que los más pequeños o más débiles tienen que utilizar la porosidad creada por otros agentes vivos o físicos o limitar su actividad a la capa de hojarasca, donde la circulación es más fácil. Nuestra ignorancia actual de la extensión espacial y la estructura del espacio poroso es una limitación importante para la comprensión real de las interacciones de los organismos en los suelos. No tener en cuenta las limitaciones espaciales de los suelos ha llevado a la investigación a subestimar el aislamiento entre organismos que viven en dominios porosos no conectados y la protección esperada contra depredadores o competidores que este aislamiento puede proporcionar (Postma y van Veen 1990; Crawford et al. 2005). Esto también ignora el efecto del aislamiento de las fuentes de alimentos y de cualquier asociación mutua que ayude a resolver este problema. Aunque intuitivamente se percibe que los modelos generales de relaciones depredador/presa no pueden aplicarse completamente a esta situación de aislamiento potencial, no tenemos idea de hasta qué punto esta suposición es cierta y cuán importante es no tomarla en consideración en los modelos generales. de la función del suelo. La investigación especialmente centrada en este punto proporcionaría respuestas rápidas y abriría nuevas áreas en las que desarrollar teorías ecológicas de suelos específicas. Gran parte de la experimentación sobre la ecología del suelo se ha basado en realidad en experimentos de laboratorio o de campo a pequeña escala (micro/mesocosmos), ya que las observaciones naturales de campo y los diseños experimentales, generalmente lentos y costosos, difícilmente proporcionaban las condiciones para probar un solo efecto de forma aislada mediante un experimento. . Estos enfoques proporcionaron una gran cantidad de resultados interesantes. Sin embargo, no consideraron la organización física del suelo ni las múltiples interacciones biológicas en escalas espaciales y temporales que probablemente hacen que los suelos sean muy diferentes de otros ambientes terrestres y acuáticos (Swift et al. 2004). Las condiciones de nuestros experimentos, con suelos altamente perturbados y comunidades modificadas, pueden haber reproducido las que ocurren principalmente al comienzo de los ciclos adaptativos de los ecosistemas (como los define Oldeman (1990) o Gunderson & Holling (2002)); En esta fase de reorganización del ecosistema que ocurre después de una fuerte perturbación o, por ejemplo, después de la muerte natural de los árboles en los bosques, se espera que las relaciones adversas entre organismos sean más prevalentes, ya que los mutualismos tardan más tiempo en organizarse que las condiciones adversas e involucran más organismos especializados (Allee et al. 1949; Lavalle 1986). Por lo tanto, es posible que solo hayamos explorado la parte de la función del suelo que sigue leyes generales que de otro modo estarían bien descritas, p. en ecosistemas de agua dulce; otra parte posiblemente más importante, oculta en la parte siempre grande de la varianza no explicada, puede seguir patrones que son exclusivos del suelo. Un nuevo desafío ahora es integrar las limitaciones del hábitat y sus cambios a lo largo del tiempo en nuestros enfoques, probando hipótesis que habían sido verificadas en trabajos anteriores en condiciones reales del suelo, en las diferentes escalas propuestas en el modelo mostrado en la Fig. 1.1. .4. Aún queda mucho por hacer para comprender adecuadamente el entorno del suelo, sus oportunidades y limitaciones. Esto requiere un marco conceptual renovado como el propuesto por la teoría de la autoorganización y colaboraciones con biólogos moleculares, químicos del suelo, físicos e hidrólogos que también puedan aplicar su experiencia a cuestiones impulsadas por la ecología. 1.1.8 Conclusiones El hábitat del suelo tiene características muy específicas que lo diferencian de cualquier otro que se encuentre en la biosfera, con una posible excepción de agua dulce y sedimentos marinos que tienen algunos puntos en común (Wall et al. 2004). La baja calidad de los recursos alimentarios y las limitaciones espaciales han estimulado la ingeniería de ecosistemas como proceso central. Si bien los efectos físicos de los ingenieros de ecosistemas en organismos más pequeños se han explorado razonablemente, el efecto de los mediadores químicos (por ejemplo, exudados de raíces, moco de lombriz, saliva de termitas) en otras comunidades necesita una investigación más exhaustiva descripción e interpretación. Se está acumulando evidencia de ajuste genético inducido por organismos sobre otros, ya sea a través de modificaciones en la expresión de genes (Blouin et al. 2005; Jana et al. 2009) o por transferencia horizontal de genes (Smant et al. 1998; Wang y cols. 2007; Hart et al. 2009; Sundara-murthy 2010; Pritchard 2011) abre amplias perspectivas para probar nuevas teorías ecológicas del suelo y mejorar las prácticas agrícolas. Esta ingeniería biológica puede resultar más importante que la mera ingeniería física. Esta visión integrada del funcionamiento del suelo no sólo apunta a unir escalas y disciplinas dentro de la ciencia del suelo; La creciente evidencia de que la autoorganización es una fuerza poderosa en el desarrollo de todos los ámbitos sociales, económicos y ambientales establece nuevos objetivos y abre amplios caminos para la ecología del suelo, al considerar los impulsores sociales externos de la sostenibilidad además de los factores biofísicos.

El suelo como hábitat 


Patrick Lavelle

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Figura 1.1.3 Etapa de reposo de tres especies diferentes de lombrices de tierra (a) Martiodrilus sp. (Carimagua, Colombia) descansa en una cámara al final de una galería cerrada con varias separaciones; (b) Glossodrilus sp. reposa en una cámara circular revestida con moldes de textura fina; (c) una especie no identificada de Tanzania descansa sobre una pequeña grava adherida a las paredes que impide el contacto con la pared.

Figura 1.1.4 Sistemas autoorganizados en suelos a diferentes escalas desde biopelículas y agregados microbianos (1), o agregados intermedios (2), dominio funcional del ingeniero de ecosistemas individual (3), mosaicos de dominios funcionales en un ecosistema (4) y el paisaje (5) donde se prestan los servicios ecosistémicos (Lavele et al. 2006). Cada escala está definida por una comunidad de organismos que interactúan, un conjunto de estructuras físicas que habitan y, en algunos casos, que ellos mismos han creado, y procesos que operan en esta escala de ácaro y espacio.

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Tabla 1.1.1 Parámetros Mani de las estrategias adaptativas de los organismos en suelos (Lavelle España 2001)

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Figura 1.1.2 Distribución de tamaño de los organismos del suelo por Swift et al. (1979) ilustrado por yb Decaëns (2010), con permiso de John Wiley &Sons.

Las siete grandes preguntas sobre la microbiología del suelo
(Selman

A. Waksman, Reexamined by Arthur D. McLaren)

Jan Dirk van Elsas

University of Groningen

Paolo Nannipieri

University of Firenze

INTRODUCCIÓN La microbiología ha florecido desde el descubrimiento y descripción de los microorganismos como agentes -invisibles a simple vista- que son ubicuos y tienen capacidades clave para transformar la materia y causar enfermedades. La microbiología del suelo ha sido un área de estudio clave, ya que los microbios impulsan la mayoría de los procesos biogeoquímicos relevantes que ocurren en el suelo y están presentes una inmensa diversidad de funciones microbianas. Los cursos de microbiología básica de fama mundial, impartidos primero en la Universidad Tecnológica de Delft (Beijerinck y sus discípulos), y luego llevados y desarrollados en los Estados Unidos por Stanier, Phaff y sus colegas, han aprovechado la inmensa diversidad funcional microbiana que puede encontrado en la mayoría de los suelos. Por lo tanto, se ha descubierto una enorme diversidad de funciones microbianas mediante el uso de enriquecimientos del suelo, en las que se ajustaron las condiciones para producir los microbios funcionales objetivo. De esta manera, se podría aislar del suelo una gran cantidad de fijadores de nitrógeno, oxidantes de amoníaco, reductores de nitrato, reductores de sulfato, reductores de hierro, además de fermentadores, y simples degradadores aeróbicos de carbono orgánico. Por lo tanto, el suelo ha sido descrito, durante mucho tiempo, como una fuente extremadamente rica de microorganismos funcionalmente diversos. Sin embargo, lo que permaneció relativamente desconocido en las etapas iniciales del desarrollo del conocimiento en microbiología del suelo fue cómo los procesos microbianos descubiertos realmente "funcionaban" in situ en el suelo. Por lo tanto, aunque la detección de una actividad funcional después de un enriquecimiento puede considerarse como evidencia para afirmar que tal proceso es realmente operativo en el suelo, ha faltado información sobre su escala, extensión y oportunidad. En su libro fundamental titulado Principio de microbiología del suelo (Williams & Wilkins, Baltimore, 1927), Selman A. Waksman describió las siete grandes cuestiones pendientes sobre el suelo vivo (reformulada según McLaren 1977), que son las siguientes: 1. ¿Qué organismos están activos en condiciones de campo y de qué manera? 2. ¿Qué influencias asociativas y antagónicas existen entre la microflora y la fauna del suelo? 3. ¿Qué relaciones existen entre las transformaciones de la materia orgánica del suelo (MOS) y la fertilidad del suelo? 4. ¿Cuál es el significado y la importancia del balance energético en el suelo, en particular con referencia al C y al N? 5. ¿Cómo influyen las plantas cultivadas en las transformaciones del suelo? 6. ¿Cómo se pueden modificar las poblaciones del suelo y con qué fines? 7. ¿Qué interrelaciones existen entre las condiciones fisicoquímicas del suelo y las actividades microbianas? Como aprenderemos en este libro, el suelo vivo se destaca como el hábitat con mayor diversidad de organismos y funciones que existe en este planeta. Además, las complejidades espaciales y temporales que se encuentran en la mayoría de los suelos plantean desafíos específicos para nuestra comprensión de los procesos locales que tienen lugar (ver Capítulo 1). Por lo tanto, al reconsiderar las siete grandes preguntas antes mencionadas que se plantearon hace casi 100 años, se puede afirmar con seguridad que la mayoría de ellas todavía constituyen los desafíos de la investigación en microbiología del suelo en la actualidad. En un editorial de Soil Biology and Biochemistry escrito 50 años después de que Selman Waksman publicara sus siete grandes preguntas, Arthur Douglas McLaren (1977), el "padre" de la bioquímica del suelo, reexaminó estas cuestiones. En este capítulo, analizamos hasta qué punto se ha avanzado con respecto a cada una de las preguntas de Waksman, tal como las reexaminó McLaren (Figura 2.1). 2.2 DESARROLLOS EXAMINADOS POR McLAREN McLaren (1977) resumió brevemente los avances en el conjunto de conocimientos sobre las siete preguntas que surgieron desde la publicación de las preguntas por Selman Waksman. Estos avances se referían a las interacciones entre microbios y plantas en el suelo, la distribución de microorganismos en la matriz del suelo, las formas de cuantificar las transformaciones de nutrientes en el suelo (mediante el uso de compuestos marcados) y la posibilidad de establecer modelos matemáticos cuantitativos que simulen la dinámica de los nutrientes en el suelo. sistema suelo-planta. Además, el descubrimiento de bacterias beneficiosas que estimulan el crecimiento de las plantas mediante la producción de fitohormonas, el crecimiento preferencial de bacterias en algunas partes de las raíces, el papel de las bacterias en el control biológico de las enfermedades de las plantas y el papel de las micorrizas y otros microorganismos beneficiosos en la nutrición de las plantas. fueron revisados. El primer experimento sobre dinámica de nutrientes con compuestos marcados fue llevado a cabo por Norman y Werkman (1943), quienes demostraron que el 20% de los residuos de soja enriquecidos con ISN son absorbidos por las raíces de las plantas, mientras que la mayor parte del resto se incorpora a la MOS. Posteriormente, Jenkinson y Powlson (1976) establecieron un método para determinar el tamaño del microbioma del suelo, que permite rastrear la dinámica de los nutrientes a través de las comunidades microbianas del suelo. Esto constituyó un avance importante en la cuantificación del comportamiento de los nutrientes en el sistema suelo-planta y en la mejora de los modelos que simulan esta dinámica (Cuadro 2.1). En las décadas que transcurrieron desde estos primeros logros se han producido importantes avances con respecto a las siete cuestiones. La mayoría de los desarrollos han sido impulsados por fuertes avances metodológicos en la microbiología del suelo, como se atestigua en varios otros capítulos de este libro (véanse, por ejemplo, los capítulos 12 a 19). Aquí revisamos brevemente cada una de las siete grandes preguntas sobre nuestra comprensión actual del suelo vivo. 2.3 ¿QUÉ ORGANISMOS ESTÁN ACTIVOS EN CONDICIONES DE CAMPO Y DE QUÉ MANERAS? 2.3.1 ACTIVIDADES INTRACELULARES EN LOS MICROBIOMAS DEL SUELO Las preguntas sobre las actividades microbianas en el suelo son amplias y deben definirse en el contexto de los objetivos de la investigación, así como de las condiciones específicas. Por ejemplo, la pregunta puede referirse a la actividad de oxidantes de amoníaco específicos en el suelo en condiciones aeróbicas versus anaeróbicas. Alternativamente, puede ser más amplio y abordar la degradación aeróbica del material lignocelulósico en el suelo. Las respuestas a cada una de estas cuestiones requerirán enfoques y técnicas particulares, que a menudo tienen una base molecular (véanse los Capítulos 12 a 17). Sin embargo, todavía existen problemas metodológicos sin resolver que obstaculizan el progreso en este ámbito. Las técnicas avanzadas actuales para estudiar los microbiomas del suelo se basan en análisis de ADN, ARN y/o proteínas del suelo. Además, los métodos que permiten rastrear y rastrear el destino de los átomos marcadores (en moléculas), por ejemplo, 13C, 1C y 15N, han permitido revelar la eficiencia de procesos clave en el suelo, como la fotosíntesis y la translocación de fotosintato a organismos subterráneos (Drigo et al. 2009), descomposición del carbono orgánico, fijación de nitrógeno, oxidación de amoníaco y reducción de nitratos. Un método clave aquí es el sondeo de isótopos estables, en el que se mide la incorporación de un marcador estable, por ejemplo, 13C, en biomoléculas (a menudo ADN). Consulte el Capítulo 17 para obtener más detalles. Se recomienda una combinación de los métodos antes mencionados, ya que cada uno ofrece una perspectiva diferente sobre la función (potencial), y las discrepancias están relacionadas con la estabilidad de la molécula (y, por lo tanto, con el momento de los eventos). Además, los métodos clásicos han mostrado resultados desconcertantes. Por ejemplo, la microscopía electrónica de transmisión de secciones del suelo ha demostrado que las células bacterianas están presentes principalmente en relación con los residuos de plantas en el suelo, que a menudo se encuentran en el interior de estos desechos (Foster et al. 1983). En apoyo de la presencia clave de células microbianas dentro de tales refugios fue el hecho de que la fumigación con cloroformo lisa principalmente las células de las bacterias presentes entre los agregados, pero no las de las bacterias dentro de los agregados (Ladd et al. 1996). Desafortunadamente, la aplicación de pruebas de actividad ultracitoquímica no detectó enzimas activas (y, por inferencia, microbios activos) en el suelo debido a la presencia de minerales del suelo densos en electrones con reacción cruzada y/o MOS (Ladd et al. 1996). La investigación sobre la actividad de los microbios en el suelo también debe considerar los aspectos espaciales y temporales del suelo, ya que influyen continuamente en las actividades celulares locales. Es posible que, dada la naturaleza local de las “condiciones”, una población microbiana diseminada por el suelo pueda mostrar altos niveles de actividad en sitios y/o momentos particulares, mientras que en otros permanece prácticamente silenciosa. Las mediciones de la actividad, ya sea considerando parámetros de producción como el CO2 liberado o el N2 fijado, o midiendo directamente los genes expresados, inevitablemente producirán datos promediados sobre un cierto volumen de suelo. Estos datos no reflejan con precisión la plétora subyacente de actividades locales (Cuadro 2.2). 2.3.2 ACTIVIDADES DE LAS PROTEÍNAS EXTRACELULARES DEL SUELO Una característica importante del suelo como sistema biológico es la capacidad de las partículas del suelo reactivas en la superficie para adsorber moléculas biológicas clave, como proteínas (y por lo tanto enzimas) y ácidos nucleicos (Nannipieri et al. 2003). McLaren y Peterson (1967) informaron que la adsorción de enzimas a las partículas reactivas en la superficie del suelo las protege contra la proteólisis sin pérdidas de actividad. Como se analizó en el Capítulo 16, el N extracelular proteico y peptídico, estabilizado por partículas del suelo reactivas en la superficie o atrapado en agregados del suelo, puede constituir entre el 30% y el 50% del N orgánico del suelo. Esto es mayor que el N orgánico ( principalmente proteína-N) que se localiza intracelularmente (4% en promedio) en la matriz del suelo. La bibliografía sobre proteínas extracelulares estabilizadas en suelo es extensa (Nannipieri et al. 2012) y supera la relacionada con el ADN extracelular en suelo (Pietramellara et al. 2009). En general, se ha centrado la atención en las hidrolasas extracelulares estabilizadas (como ureasas, proteasas y fosfomonoesterasas), y se ha descubierto que su estabilización depende de la adsorción en partículas reactivas en la superficie (como arcillas) o del atrapamiento en el organomineral. complejos. Estas enzimas pueden persistir en el suelo siempre que los agregados o complejos organominerales que las atrapan no se rompan (Nannipieri et al. 2012). 2.4 QUÉ INFLUENCIAS ASOCIATIVAS Y ANTAGONÍSTICAS ¿EXISTE ENTRE LA MICROFLORA Y FAUNA DEL SUELO? Desde la aparición del concepto de interacciones microbianas (asociativas y antagonistas) en el suelo, se han logrado grandes avances en esta área. Esto se refiere tanto a las interacciones entre diferentes miembros de los microbiomas del suelo como a aquellas entre estos y los componentes de la fauna del suelo y/o las raíces de las plantas. En el trabajo clásico basado en cultivos, se ha identificado una amplia gama de interacciones antagónicas o sinérgicas entre los microorganismos del suelo. El Capítulo 9 analiza algunas de las interacciones que ocurren entre los diferentes microbios del suelo. También se centra en la forma en que se encuentran los microbios en el suelo (espacialmente explícita, a menudo en biopelículas que se adhieren a las superficies). Es exactamente aquí donde radica el quid de nuestra comprensión del microbioma del suelo. Claramente, la estructura espacial heterogénea y compleja que ocurre en la mayoría de los suelos tiene una fuerte influencia en las interacciones, que a menudo son espacialmente explícitas. Por lo tanto, es precisamente en este ámbito donde se han logrado y se seguirán logrando la mayor parte de los avances. Un ejemplo particular de ello lo encontramos en los llamados puntos calientes de actividad en el suelo, como la rizosfera, la micosfera y otras "esferas" similares. En estos hábitats, vemos una variedad de desarrollos de nuestro conocimiento. En algunos casos, las interacciones microbio-microbio se comprenden al nivel molecular más fino, y dichos datos han surgido principalmente en estudios realizados en sistemas que imitan el suelo. Por ejemplo, en un estudio realizado con agar extracto de suelo, Haq et al. (2017) encontraron que un grupo de cinco genes que participa en la generación de energía (presumiblemente a expensas del glicerol y el oxalato exudados por hongos) está altamente regulado en Burkholderia (recientemente reclasificado a Paraburkholderia) terrae en interacción con el hongo del suelo Lyophyllum sp. . tensión Karsten. El conjunto de genes aparentemente dotó al organismo de una maquinaria de "puesta en marcha" que le permitió responder inmediatamente al exudado fúngico emergente. Un gran conjunto de otros avances actuales con respecto a los mecanismos que subyacen a las interacciones en el suelo también apuntan a desentrañar los eventos moleculares que desencadenan respuestas asociativas o antagónicas particulares (ver Capítulo 9). Lo que surge de la gran bibliografía sobre este tema es que, a lo largo del tiempo evolutivo, el suelo ha actuado como una matriz compleja y diversa, en la que ha surgido una enorme diversidad de interacciones simbióticas, neutrales y/o antagónicas, impulsadas por las reglas darwinianas. de evolu-ción. Sin embargo, todavía estamos lejos de comprender cómo el suelo modula tales interacciones, por lo que se prevé que, además de los estudios sobre sistemas que imitan el suelo, los estudios de suelos del mundo real sigan siendo necesarios en futuros esfuerzos de investigación. 2.5 QUÉ RELACIONES EXISTEN ENTRE ALGUNOS¿TRANSFORMACIONES Y FERTILIDAD DEL SUELO? 2.5.1 LA IMPORTANCIA DEL SOM Ya en los primeros trabajos se hizo evidente que la fertilidad del suelo estaba intrínsecamente ligada a la materia orgánica del suelo, a pesar de la existencia de algunas excepciones a esta regla. La excepción está ilustrada por un curioso hallazgo descrito por McLaren (1977). Descubrieron que un suelo alofánico tenía baja fertilidad a pesar de su alto contenido de C orgánico. En este suelo se encontró una disminución de los procesos de mineralización (y por tanto de la liberación de nutrientes que podrían ser absorbidos por la planta), y los compuestos orgánicos resultaron estar complejados con los alófanos. En la investigación actual, el uso de compuestos orgánicos marcados (ver Sección 2.3) nos permite determinar la dinámica cuantitativa de los nutrientes en el sistema suelo-planta. Por ejemplo, el uso de fertilizante enriquecido con ISN puede distinguir entre el comportamiento del fertilizante N y el del N del suelo, y así cuantificar qué porcentaje de absorción de N de la planta es satisfecho por el fertilizante agregado en comparación con el del N mineralizado del N orgánico del suelo. El llamado efecto priming, es decir, el cambio en la tasa de mineralización de la MOS debido a la adición de un compuesto orgánico al suelo, se puede determinar utilizando compuestos marcados con C. Por lo tanto, se ha documentado ampliamente el papel de la MOS como base de la fertilidad del suelo en muchos suelos. Sin embargo, las actividades humanas durante las últimas décadas han cambiado significativamente los equilibrios regionales y globales de la MOS, con efectos sobre el cambio climático. Esto a menudo ha sido perjudicial para la fertilidad del suelo (García et al. 2018). Además, existe la necesidad de preservar o incluso mejorar la MOS en los suelos, dados los efectos negativos del agotamiento de la MOS en el clima. Por lo tanto, las prácticas de manejo agrícola y forestal apuntan cada vez más a almacenar C orgánico en el suelo para contrarrestar la liberación de CO a la atmósfera (ver también el Capítulo 25). Además, las interacciones entre la MOS y los sistemas humanos-naturales complejos requieren nuevas investigaciones sobre los presupuestos regionales y globales de la MOS. 2.5.2 EL CONCEPTO DE CALIDAD DEL SUELO En 1994, Doran y Parkin introdujeron el concepto de calidad del suelo, definido como "la capacidad de un suelo de funcionar dentro de los límites del ecosistema para sostener la productividad biológica, mantener la calidad ambiental y promover la salud de las plantas y los animales". Esta definición es más amplia que la de fertilidad del suelo, ya que también contiene el papel del suelo en la productividad vegetal y biológica y en la atenuación del impacto de los contaminantes y patógenos ambientales. Además, esta definición aborda la importancia del suelo para la salud vegetal, animal y humana. Es importante determinar los cambios en la calidad del suelo, ya que los suelos se ven afectados tanto por los cambios climáticos como por las actividades humanas, incluidas las prácticas agrícolas intensivas. La calidad del suelo está relacionada con las propiedades biológicas, químicas y físicas del suelo, pero desafortunadamente estos parámetros están entrelazados y no es posible tener una evaluación inequívoca de (los cambios en) la calidad del suelo. En un artículo reciente (Schloter et al. 2018), se enfatizó la necesidad de desarrollar indicadores moleculares robustos, confiables y resilientes para monitorear la calidad del suelo. Además, se han seleccionado indicadores biológicos, químicos y físicos. Sin embargo, las propiedades químicas y físicas del suelo son menos sensibles que las biológicas, y esto influye en los cambios (posteriores) en el contenido de MOS, que está relacionado con la calidad del suelo (Nannipieri et al. 2003). Además, en el pasado, los indicadores biológicos de la calidad del suelo se centraban principalmente en la parte visible de la biota del suelo, descuidando el microbioma (Schloter et al. 2018). Por lo tanto, se ha enfatizado la necesidad de desarrollar indicadores que reflejen la actividad microbiana del suelo, ya que los microbiomas del suelo desempeñan un papel predominante al afectar la funcionalidad del suelo (Schloter et al. 2018, Stott et al. 2009). Sin embargo, de los diez indicadores que se han propuesto para evaluar la calidad del suelo, sólo la biomasa microbiana C y la nitrificación potencial se basaron en parámetros microbiológicos (Andrews et al. 2004). Por tanto, Schloter et al. (2018) propusieron tener en cuenta genes que codifican proteínas que participan en procesos microbianos clave, como varios pasos de los ciclos de N, C y P, en el suelo. Se propuso el desarrollo de varios de estos genes como indicadores y otros pueden derivarse de la extensa bibliografía sobre análisis de suelos de base molecular. 2.6 ¿CUÁL ES EL SIGNIFICADO Y LA IMPORTANCIA DEL BALANCE ENERGÉTICO EN EL SUELO, EN PARTICULAR CON REFERENCIA A C Y N? 2.6.1 LOS PROCESOS QUE DETERMINAN EL PAPEL DEL C EN EL SUELO El C orgánico juega un papel clave en la funcionalidad del suelo, ya que afecta las propiedades biológicas, químicas y físicas del suelo. Las propiedades biológicas incluyen la biodiversidad del suelo. El suelo tiene un papel de fuente/sumidero en términos de carbono, por lo que puede actuar como fuente o sumidero neto de carbono. Como se analizó brevemente en el capítulo 1, el carbono localizado de manera estable en el suelo (en la MOS) a menudo está presente en macromoléculas altamente complejas. mientras que el C lábil abarca moléculas más pequeñas que son más propensas a la utilización y conversión en biomasa y CO. Los objetivos actuales de las prácticas de gestión del suelo (microbioma) son fomentar la función de almacenamiento de C orgánico del suelo para contrarrestar un aumento de los niveles de CO2 atmosférico (García et al. 2018). Esto implica que los procesos de fijación de CO2 (autótrofos) deben estimularse a expensas de los procesos de "quema" de C (heterótrofos). En el suelo, los primeros procesos los llevan a cabo principalmente plantas, algas y una variedad de bacterias autótrofas, incluidas las cianobacterias. La eficiencia del uso de carbono por parte de la microbiota del suelo se ha estudiado a menudo mediante un enfoque "holístico", considerando el microbioma del suelo como un conjunto completo (biomasa microbiana C) y el C respirado como COz. Anderson y Domsch (1990) propusieron el CO, (la relación entre C-CO y biomasa microbiana C) como índice para evaluar la cantidad de C orgánico que se incorpora a la biomasa microbiana. Se consideró que los valores altos de CO2 eran indicativos de estrés microbiano, ya que en condiciones de estrés, se respira una mayor cantidad de C para reparar los daños metabólicos debidos al estrés. Sin embargo, la relación también depende de otros factores además de las tensiones. Por ejemplo, los cambios en las biomasas fúngicas/bacterianas pueden afectar la proporción, ya que los hongos respiran menos C que las bacterias por unidad de C incorporado (Wardle y Ghani 1995). 2.6.2 LOS PROCESOS QUE DETERMINAN EL PAPEL DEL N EN EL SUELO El segundo elemento importante para los microbiomas del suelo es el N. El N del suelo está sujeto a ciclos a través de diferentes formas químicas, como se describe con más detalle en el Capítulo 11. El ciclo del N en el suelo se caracteriza por muchas reacciones y pérdidas. La fijación biológica de N, la nitrificación, la desnitrificación, la mineralización e inmovilización/renovación de N, la volatilización de amoníaco, la lixiviación de N y la pérdida de N por escorrentía son procesos que se conocían incluso antes de la época de Waksman y más tarde de McLaren. Además, más adelante se descubrieron aún más pasos ciclistas. Por ejemplo, el N20 se puede producir no sólo mediante desnitrificación sino también mediante desnitrificación con nitrificador (Nannipieri y Paul 2009). La oxidación anaeróbica de amoníaco (Anammox), la oxidación de amoníaco a gas N2, con la reducción concomitante de nitrito, puede ocurrir en condiciones anaeróbicas en el suelo (Nannipieri y Paul 2009). La oxidación del amoníaco a nitrito, el primer paso del proceso de nitrificación, se lleva a cabo no sólo por bacterias oxidantes del amoníaco sino también por arqueas oxidantes del amoníaco. Además, un hallazgo novedoso indica la existencia de una vía de nitrificación completa en los lechos de arena de purificación de agua potable en un organismo, Nitrospira, en lugar del proceso clásico de dos especies llevado a cabo por Nitrosomonas (oxidación de amoníaco a nitrito) y Nitrosospira (oxidación de nitrito a nitrato) (Daims et al. 2015). Es una cuestión abierta hasta qué punto el consorcio de dos especies supera y, por tanto, prevalece sobre el sistema de un solo organismo en entornos de suelo. Finalmente, las bacterias que oxidan el amoníaco, como las especies Nitrosococcus y Nitrosospira, también contienen genes que catalizan las enzimas del proceso de desnitrificación (Norton et al. 2008). Los procesos de ciclo de N se detallan con más detalle en el Capítulo 11. Generalmente, si el N es el nutriente limitante, la degradación del C orgánico aumentará a medida que se agrega N inorgánico al suelo. De manera similar, si P y S son los nutrientes limitantes en el suelo, la tasa de degradación aumentará si se agregan al suelo compuestos inorgánicos de P y/o S, respectivamente. Sin embargo, esto no siempre se observa, ya que la calidad del C orgánico del suelo también es un determinante importante. Por ejemplo, la degradación de la lignina disminuye con una alta disponibilidad de N, ya que las ligninasas responsables de la degradación de la lignina son inhibidas por el N inorgánico (Knorr et al. 2005). Según la teoría de la estequiometría ecológica, las proporciones elementales en el suelo determinan la retención de nutrientes y la producción de biomasa (Sterner y Elser 2002). Como consecuencia, la estequiometría elemental de la biomasa microbiana del suelo (con una relación media C:N:P de 60:7:1) determinará la demanda microbiana de C, N y P en relación con la disponibilidad de estos elementos en el suelo ( Sinsabaugh y otros 2009). La proporción media de actividades de cuatro enzimas [B-1,4-glucosidasa, B-1,4-N-acetilglucosaminidasa, leucina aminopeptidasa y fosfomonoesterasa ácida o alcalina (esta última medida dependiendo del pH del suelo)], involucradas en C, La dinámica del N y del P fue aproximadamente 1:1:1 en todas las muestras de suelo y sedimentos investigadas (Sinsabaugh et al. 2009). Sin embargo, mientras que las actividades B-1,4-glucosidasa y ambas fosfomonoesterasa son representantes de la mineralización de C orgánico y P orgánico, respectivamente, no hay evidencia de que tanto la actividad B-1,4-N-acetilglucosaminidasa como la leucina aminopeptidasa puedan servir como representantes de la mineralización. Mineralización de N orgánico (Nannipieri et al. 2018). 2.6.3 EL FLUJO DE ENERGÍA EN EL SUELO Con respecto al flujo de energía en el suelo, Gray y Williams (1971) ya sugirieron que la mayoría de los aportes de energía al suelo (de la energía solar capturada por plantas, algas y cianobacterias) servirán para mantener los microbiomas en lugar de permitir un gran crecimiento microbiano. Esto ha dado lugar al concepto de tiempos prolongados de generación microbiana en la mayoría de los suelos. En otras palabras, la (lenta) formación de nueva biomasa microbiana se compensa con la muerte gradual de partes "viejas" de la biomasa, y esto da como resultado un equilibrio algo dinámico. Por tanto, tanto las condiciones del suelo como la tasa de entrada de energía determinarían la dinámica de la biomasa, lo que daría lugar al concepto de "capacidad de carga", que es característico de cada suelo. Las bajas tasas de crecimiento promedio subyacentes en la mayoría de los microbiomas del suelo indican que las transformaciones microbianas también serían lentas, en promedio. Sin embargo, estos cálculos se han basado en la biomasa microbiana en su conjunto, sin considerar que los suelos presentan puntos calientes (sitios con mayor densidad y actividad microbiana) y "momentos calientes" que se caracterizan por la presencia (repentina y efímera) de sustratos disponibles para crecimiento microbiano (Kuzyakov y Blagodatskaya 2017). El cálculo de las tasas de crecimiento microbiano en el suelo dentro y fuera de los puntos calientes (sitios con mayores densidades y actividades microbianas) y/o momentos calientes (repentinos y efímeros) sigue siendo un objetivo de investigación desafiante, considerando también que los microorganismos del suelo pueden formar estructuras de reposo. en condiciones de hambruna. 2.7 ¿CÓMO INFLUYEN LAS PLANTAS CULTIVADAS EN LAS TRANSFORMACIONES DEL SUELO? Está bien establecido que, en la mayoría de los suelos, el suelo bajo la influencia de las raíces (suelo rizosférico) tiene una mayor biomasa microbiana con mayor actividad que el suelo en masa. Este llamado efecto rizosfera se debe a la liberación de fotosintatos y compuestos derivados producidos por la planta, y a la rizodeposición de compuestos provenientes de la lisis de las células epiteliales de las raíces. Garbeva et al. (2004) examinaron los efectos relativos del tipo de suelo, el tipo de planta y el manejo agrícola en los microbiomas del suelo. El tipo de suelo, como se refleja en las propiedades del suelo, es a menudo más importante que el tipo de especie vegetal al afectar la diversidad microbiana del suelo de la rizosfera, al menos después de algunos años de monocultivo. De Ridder-Duine et al. (2005) demostraron que Carex arenaria, una especie de planta no micorrízica (elegida para evitar el efecto de confusión por diferentes colonizaciones micorrízicas), cultivada en diez suelos con diferentes propiedades, no afectó la diversidad bacteriana local, como lo demuestra la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). seguido de electroforesis en gel con gradiente desnaturalizante. Más bien, estos dependían de las propiedades del suelo. Inceoglu et al. (2010) revelaron diferencias sutiles en los bacteriomas de la rizosfera (evaluados mediante secuenciación de ADN) ejercidos por las raíces de diferentes genotipos de papa en el mismo suelo. Por tanto, los efectos son diversos y dependen en gran medida del sistema utilizado, así como de los métodos de análisis. Además, estos estudios no abordaron los efectos sobre las funciones microbianas. Con respecto a estos, un estudio reciente demostró que el maíz con una mayor eficiencia en el uso de N (NUE) seleccionó comunidades bacterianas en el suelo de la rizosfera que difieren en los genes que codifican la B-glucosidasa y con una mayor actividad de B-glucosidasa que el maíz con una menor NUE ( Pathan et al.2015). Además, la primera línea también tenía una mayor actividad proteasa y una mayor abundancia de genes codificadores de proteasas en su rizosfera que la segunda. Es importante subrayar que los efectos espaciotemporales son importantes en la rizosfera, los cuales pueden estudiarse en condiciones de laboratorio, utilizando rizoboxes (Neuman y Romheld 2007). Por ejemplo, la exudación radicular se limita principalmente a las zonas apicales de las raíces y no siempre es constante sino que sigue ritmos diurnos. Un estudio de metatranscriptómica mostró que las actividades de muchos taxones procarióticos aumentaron por la exudación de las raíces de las plantas de cebada antes del amanecer en comparación con la etapa posterior al amanecer (Baraniya et al. 2017). Por lo tanto, es plausible plantear la hipótesis de que, en condiciones de campo, el efecto de la rizosfera se produce en oleadas dependiendo de la luz solar, mientras que se pierde cuando el suelo cultivado en monocultivo se ara después de la cosecha. 2.8 ¿CÓMO SE PUEDEN MODIFICAR LAS POBLACIONES DEL SUELO Y CON QUÉ FINES? La importancia del tipo de suelo, reflejada en las propiedades del suelo, como factor determinante de la composición de los microbiomas del suelo, fue demostrada por primera vez, en un conjunto de suelos, por Gelsomino et al. (1999) y posteriormente confirmado por varios otros estudios. Por ejemplo, Delmont et al. (2014) estudiaron recientemente la diversidad microbiana de dos suelos (uno de un pastizal del sitio experimental a largo plazo en la Estación Experimental Rothamsted en Harpenden, Inglaterra, y el otro de un bosque en Vallombrosa, Florencia, Italia) tratados para tener ya sea la misma comunidad microbiana o la del otro suelo. El estudio demostró que la composición funcional y taxonómica de los respectivos microbiomas era la del suelo que recibía el inóculo y no la del suelo "donante". Por lo tanto, los suelos pueden ser bastante "recalcitrantes" a los cambios del microbioma, con un presunto gran efecto de la matriz del suelo. Presumiblemente, el tipo de matriz del suelo determina, en gran medida, la distribución de nutrientes, agua y otras "condiciones" sobre los agregados y poros del suelo. Por lo tanto, es el impulsor clave de la distribución del nicho de espacio habitable para formas microbianas adaptadas, lo que resulta en la aparente reticencia de los microbiomas del suelo al cambio. Sin embargo, para muchos propósitos, como el control biológico de enfermedades de las plantas, el aumento de la fertilidad y/o la biorremediación, puede ser deseable modificar los microbiomas del suelo, como ya sugirió Waksman (1927). El objetivo sería establecer nuevos organismos que sean beneficiosos para el funcionamiento del suelo, ya sea en términos de fertilidad o estimulación de la salud de las plantas, o promover la degradación de, por ejemplo, compuestos contaminantes. Estos objetivos han estado en la agenda de investigación durante varias décadas. Estos fueron también los temas principales de las primeras investigaciones de Waksman (1927). Uno de los enfoques clave adoptados para modificar los microbiomas del suelo ha sido la introducción de (micro)organismos con la función deseada, mientras que otro enfoque se ha basado en la modulación de los parámetros del suelo, por ejemplo, mediante la adición de "sustratos" como estiércol, biocarbón y/o residuos de cultivos, con el objetivo de promover la aparición y la actividad de organismos beneficiosos presentes de forma natural. Aunque hay informes de introducciones exitosas, por ejemplo, de rizobios que favorecen la adquisición de nitrógeno del suelo de la atmósfera, se han identificado obstáculos importantes. Estos radican en la reticencia del suelo a cambiar después de la introducción de organismos. Como se discutió anteriormente, la razón de esta "recalcitrancia" puede radicar en gran medida en la falta de un nicho abierto para los organismos entrantes (van Veen et al. 1997, Mallon et al. 2015), un fenómeno denominado suelo microbiostasis. Aunque hemos mejorado mucho la comprensión de cómo pueden funcionar los organismos beneficiosos para las plantas (ver Capítulo 22), el éxito de la introducción de muchos de esos organismos no está garantizado como resultado de la falta de conocimiento sobre cómo darles un "nicho abierto". " en la tierra. Con respecto a la segunda opción de modular el microbioma del suelo mediante enmiendas del suelo, la revisión antes mencionada de Garbeva et al. (2004) es importante, ya que analiza los factores que influyen en la composición del microbioma del suelo, que son los siguientes: 1. Impulsado por planta 2. Tipo de suelo impulsado 3. Impulsada por la gestión del suelo Los tres grupos de impulsores complejos se consideran importantes y, con respecto a sus efectos sobre los microbiomas del suelo, se dividieron en varios subfactores: tipos y niveles de nutrientes/materia orgánica (por ejemplo, de exudados de raíces, reorganización del suelo por, por ejemplo, el arado), el nivel de pH (por ejemplo, afectado por los procesos del suelo), el régimen hídrico (por ejemplo, afectado por la succión de agua de las plantas, el régimen agrícola, el tipo de suelo) y otros factores (por ejemplo, el estrés biótico ejercido por los depredadores). Aunque, como hemos visto, los microbiomas del suelo suelen ser muy recalcitrantes al cambio, pueden cambiar, aunque lentamente, cuando se cambia/modula cualquiera de esos parámetros del suelo. Parece que los cambios que se pueden efectuar dependen en gran medida del contexto (tipo de suelo y clima) y, por lo tanto, se necesita investigación caso por caso para desarrollar las mejores prácticas para cambiar la actividad, la biomasa y composición de los microbiomas del suelo en la dirección planificada. 2.9 QUÉ INTERRELACIONES EXISTEN ENTRE FISICOQUÍMICOS ¿CONDICIONES DEL SUELO Y ACTIVIDADES MICROBIANAS? Actualmente se sabe que, entre otros factores, las condiciones abióticas particulares del suelo impulsan la estructura y la actividad de los microbiomas del suelo. Aquí, es importante discernir hasta qué punto operan los diferentes impulsores y en qué medida afectan a los diferentes miembros de los microbiomas del suelo. Como ejemplo, se ha demostrado ampliamente, en una amplia gama de suelos, que el pH del suelo es un importante impulsor de la estructura de las comunidades bacterianas del suelo; la caída del pH a valores inferiores a 5,0 es fuertemente selectiva (Rousk et al. 2010 ). Véase también el Capítulo 1 y el Recuadro 1.1. Este hallazgo se relaciona fácilmente con nuestra comprensión del comportamiento de las bacterias ante cambios de pH; un valor de pH inferior a 5,0 es fuertemente prohibitivo para la mayoría de las bacterias y permite distinguir entre tipos sensibles a los ácidos y acidófilos. Por otro lado, los hongos del suelo se ven menos afectados por los cambios en el pH del suelo. Por ejemplo, determinados hongos, como Penicillium y Fusarium spp., pueden crecer a valores de pH de hasta 13, mientras que otros hongos prefieren condiciones ligeramente ácidas (alrededor de pH 5,2-5,5) (Thorn 2012; consulte el Capítulo 5). Por tanto, la actividad fúngica en el suelo puede verse estimulada por la presencia de compuestos orgánicos (ácidos) de origen vegetal y animal. Su papel en la degradación de celulosa, hemicelulosa, lignina y quitina se analiza con más detalle en el Capítulo 5. Como se describió en el Capítulo 1, el régimen hídrico del suelo es un fuerte regulador de la vida microbiana del suelo. El agua del suelo obviamente depende de las condiciones climáticas (lluvia versus sequía), así como de las características de drenaje del suelo. Los suelos con características de drenaje deficientes (por ejemplo, suelos arcillosos), cuando se exponen a lluvias intensas y frecuentes, presentan condiciones predominantes de saturación de agua, que provocan anoxia. Esto contrasta fuertemente con los suelos de fácil drenaje (por ejemplo, suelos arenosos), que pueden resultar en gran medida óxicos, en promedio. Sin embargo, este último régimen puede implicar que también se produzcan períodos de sequía, que pueden ser extensos. En condiciones tan secas, las actividades de los microbiomas locales prácticamente quedarán estancadas. Por lo tanto, las consecuencias del régimen hídrico predominante en un suelo, que da como resultado niveles de agua que varían entre 0% y 100% de la capacidad de retención de agua y, por lo tanto, oxia versus anoxia, son grandes. Los respectivos microbiomas necesitarán cambiar su metabolismo de una respiración prácticamente estancada (período de sequía) a una respiración aeróbica (oxia en la mayoría de los poros del suelo), a una respiración anaeróbica (usando aceptores terminales de electrones alternativos, ver el Capítulo 1) o fermentación (anoxia en la mayoría de los poros). Finalmente, el régimen de manejo agrícola es un determinante importante de la dinámica del microbioma del suelo, ya que las condiciones locales del suelo pueden verse fuertemente afectadas por medidas como el arado, la labranza, la rotación de cultivos y la aplicación de fertilizantes y desechos animales. La bibliografía sobre los efectos de diferentes regímenes de manejo agrícola, que causan diferentes efectos ambientales, en la diversidad microbiana del suelo está creciendo, pero los hallazgos respectivos sólo deben revisarse cuando se obtengan datos de diferentes suelos y manejos agrícolas. Una faceta clave, discutida en muchos foros científicos, es la tendencia de la diversidad microbiana a "erosionarse" a medida que aumenta progresivamente la intensidad del uso (agrícola) de la tierra. Este fenómeno aparentemente tiene implicaciones para características importantes del suelo, por ejemplo, la supresión de enfermedades de las plantas (que se analiza más detalladamente en el Capítulo 21). 2.10 CONCLUSIONES Y PERSPECTIVAS Después de unos 100 años de investigación en microbiología del suelo, podemos dividir los avances científicos en varias partes, es decir, el período que va desde la era temprana de la microbiología (en la que Winogradsky, Beijerinck y Waksman desempeñaron papeles fundamentales), pasando por la era tipificada por McLaren (suelo bioquímica y procesos) hasta la época actual. Figura 2.2. proporciona una descripción gráfica del desarrollo de la microbiología del suelo, destacando algunos hallazgos importantes. Teniendo en cuenta esta cifra, nos viene a la mente preguntarnos: "¿dónde nos encontramos ahora con respecto a la comprensión y el fomento de la funcionalidad de nuestros suelos, y cuáles son los objetivos decenales para el futuro?" La disponibilidad de un número suficiente de suelos de alta calidad y muy fértiles es la base del sustento de la vida en este planeta. La clave para la supervivencia de los seres humanos bajo los efectos de una población en rápido crecimiento y el cambio climático actual reside en nuestra capacidad para preservar y/o mejorar nuestros preciosos suelos vivos en términos de su funcionamiento y su calidad. En particular, la mitigación del aumento de los niveles de CO atmosférico requiere una mayor atención al potencial de mejorar la capacidad inherente de muchos suelos para actuar como sumideros de carbono eficaces. Con respecto a la comprensión del suelo vivo y sus funciones, se puede afirmar con seguridad que se han generado enormes conjuntos de datos que documentan las capacidades de diversos organismos del suelo con respecto a la transformación de compuestos bioquímicos clave en el suelo, las interacciones con otros organismos y la modulación de la calidad y fertilidad del suelo. Sin embargo, todavía estamos lejos de una comprensión completa del funcionamiento del sistema vivo del suelo. Es importante comprender que esta función debe considerarse en el contexto del sistema particular estudiado (dependencia del contexto). En términos del destino de los compuestos clave, podemos cuantificar la dinámica de al menos algunos nutrientes, utilizando un enfoque holístico y con la ayuda de compuestos etiquetados. Por ejemplo, en el caso del N, los principales depósitos en el suelo son el N de biomasa microbiana, el N orgánico, el N de amonio intercambiable y fijo (o no intercambiable), el N de nitrato y el N absorbido por las plantas. En un estudio, el amonio representó casi el 25% de la urea enriquecida con ISN aplicada a un campo de sorgo, mientras que el fertilizante absorbido por el sorgo representó el 21% y el N inmovilizado en la biomasa microbiana fue aproximadamente el 5% en el momento de la cosecha (Nannipieri et al. otros 1999). Sin embargo, nuestros métodos analíticos aún están lejos de ser óptimos y aún no están lo suficientemente perfeccionados para el análisis de una amplia gama de tipos de suelo. Esto, en combinación con la enorme diversidad de organismos en la mayoría de los suelos y la red altamente intrincada de interacciones que pueden ocurrir, de manera espaciotemporalmente explícita, a través de estos suelos, nos impide abarcar todos los aspectos de los análisis del microbioma del suelo. Como aprendemos en los Capítulos 1 y 3, incluso dentro de un solo suelo el nivel de homogeneidad puede ser bajo. La mayoría de los suelos del mundo consisten en una colección de "islas" para la vida y función microbiana, donde las reglas ecológicas que determinan la función del suelo pueden tener que ser determinadas localmente. ¿Cómo podemos avanzar en nuestro análisis y exploración de las funciones del suelo? Dada la inmensa diversidad y variación entre los suelos y sus microbiomas, abogamos por que los estudios futuros (1) se realicen caso por caso y (2) consideren la heterogeneidad local dentro del compartimento del suelo que se está analizando. En otras palabras, cada sistema de suelo debe considerarse como un sistema intrincado en sí mismo, teniendo en cuenta sus propias complejidades y legados. Puede ser demasiado limitado comparar simplemente los resultados experimentales en un suelo con los de otros suelos. Más bien, una comprensión más profunda de cada sistema de suelo debe provenir de estudios repetidos del mismo sistema, utilizando variaciones de condiciones y escala de muestreo, e incluyendo series temporales replicadas de desarrollo. La propuesta de definir el suelo de Rothamsted -donde más de 100 años de estudio histórico proporcionan una excelente base de referencia- como un suelo "modelo" para la exploración mediante técnicas metaómicas es un buen ejemplo de tal enfoque (Vogel et al. 2009, Delmont et otros 2012). Sin embargo, en los primeros análisis que se realizaron, solo el 34,5% de las lecturas metagenómicas fueron asignadas para funcionar, y solo

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FIGURA 2.1 Representación de las siete grandes preguntas de Selman A. Waksman sobre el funcionamiento del suelo (microbioma).

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